Title of article :
RAPD ANALYSIS OF GENETIC VARIATION WITHIN AND AMONG NATURAL POPULATIONS OF TWO SPECIES OF DIANTHUS L. (CARYOPHYLLACEAE) IN NE IRAN
Author/Authors :
بهروزيان، مريم نويسنده Behrozian, M , جعفري، آذرنوش نويسنده دانشيار گروه زيست شناسي، دانشكده علوم، دانشگاه آزاد اسلامي واحد مشهد، مشهد، ايران. , , فارسي، محمد نويسنده استاد گروه بيوتكنولوژي گياهي، پژوهشكده علوم گياهي، دانشگاه فردوسي مشهد، مشهد، ايران. ,
Issue Information :
سالنامه با شماره پیاپی 38 سال 2013
Abstract :
در اين مطالعه تنوع ژنتيكي 69 فرد از نه جمعيت طبيعي متعلق به دو گونه Dianthus موجود درشمال شرق ايران با استفاده از دادههاي PARD به منظور دستيابي به اطلاعات مهم ژنتيكي بررسي گرديد. 111 باند چندشكلي با كمك 11 آغازگر RAPD بدست آمد. درصد باندهاي چند شكلي، تنوع ژنتيكي ني و انديس شانون محاسبه گرديد. دندروگرام بر اساس روش UPGMA جمعيتهاي مورد بررسي را به دو گروه اصلي مطابق با دو گونه جدا نمود و نزديكي دو زيرگونه D. polylepis subsp. polylepis و D. polylepis subsp. binaludensis را نسبت به هم نشان داد. بر اساس آناليز AMOVA به ترتيب 82 و 18 درصد تنوع ژنتيكي براي درون و بين جمعيتها بدست آمد. همچنين آناليز مختصات اصلي (PCA) بر پايه فاصله اقليدوسي اختلاف سه جمعيت زيرگونه D. crinitus subsp. turcomanicus را از نظر ژنتيكي با شش جمعيت از دو زيرگونه . polylepis subsp. polylepis D و D. polylepis subsp. binaludensis آشكار كرد. با توجه به نتايج به دست آمده، فاصله جغرافيايي، سيستم آميزشي و جريان ژني مي تواند اثرات مهمي در تنوع ژنتيكي جمعيتهاي جنس Dianthus داشته باشد.
Abstract :
In this study we investigated the genetic variation, using RAPD data in 69 individuals of nine natural populations representing two species of Dianthus L. growing in Northeast of Iran. Eleven RAPD primers generated 111 polymorphic DNA bands. The percentage of polymorphic bands, Nails genetic diversity (h), as well as Shannon index (I), were assessed. A dendrogram based on UPGMA segregated examined populations into two main clusters matching the two species and the two subspecies of Dianthus polylepis subsp. polylepis and D. polylepis subsp. D. binaludensis were to each other. AMOVA showed 82% and 18% of the variation within and among populations respectively. Furthermore, principal coordinate analysis (PCA) based on a Euclidean metric revealed that three populations of D. crinitus subsp. turcomanicus were genetically different from six populations of D. polylepis. According to our results, geographical distances, mating system and gene flow have important effects on genetic polymorphism of populations.
Journal title :
Iranian Journal of Botany
Journal title :
Iranian Journal of Botany