Author/Authors :
هيرماس، چاناباسايا نويسنده MVSc in Veterinary Microbiology, Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand 388001, Gujarat, India Hiremath, C , جلا، مايوردواج كيسانسيه نويسنده Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand 388001, Gujarat, India Jhala, M. K , بندري، برات بابوباي نويسنده Department of Veterinary Microbiology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand 388001, Gujarat, India Bhanderi, B. B , جوشي، چيتانيا گياندوپراساد نويسنده Department of Animal Biotechnology, College of Veterinary Science and Animal Husbandry, Anand Agricultural University, Anand 388001, Gujarat, India Joshi, C. G
Abstract :
ويروس كم خوني جوجه با روش واكنش زنجيره‌اي پليمراز در نمونه بافت‌هاي جمع‌آوري شده از گله‌هاي طيور در گوجارات، هند مشاهده شد. توالي ژن‌هاي VP1، VP2 و VP3 از ويروس CAV آناند (ويروس كم خوني جوجه گوجارات) بعد از كلون كردن محصولات واكنش زنجيره‌اي پليمراز در وكتور pDrive به دست آمد. در توالي نوكلئوتيدي اين ويروس با توالي ديگر ويروس‌هاي CAV، به ترتيب 8/98%-95%، 8/99%-8/98% و 100%-8/98% ناحيه مشابه براي ژن‌هاي VP1، VP2 و VP3 نشان داده شد. بررسي توالي اسيدهاي آمينه 7/99%-7/91%، 100%-99% و 100%-3/97% شباهت را براي ژن‌هاي VP1، VP2 و VP3 نشان داد كه نشان دهنده سطح بالايي از حفاظت ژنوم در اين ويروس است. علاوه بر اين، با قرار دادن نوكلئوتيدها و اسيدهاي آمينه در نواحي خاصي از ژنوم ويروس CAV آناند، مشخص گرديد كه احتمالا اين ويروس داراي عوامل بيماري‌زاي بيشتر است. جدايه‌هاي CAV در گروه‌هاي فيلوژني هم قرار گرفتند كه مستقل از منشاء جغرافيايي ويروس بود.
Abstract :
Chicken anemia virus was detected by PCR in tissue samples collected from poultry flocks in Gujarat, India. The VP1, VP2 and VP3 gene sequences of CAV from Anand, Gujarat were obtained after cloning the PCR products in pDrive cloning vector. Nucleotide sequence alignment with other CAV sequences demonstrated overall identity of 95-98.8%, 98.8-99.8% and 98.8-100% for VP1, VP2 and VP3 regions, respectively. Deduced amino acid sequences revealed 91.7-99.7%, 99-100% and 97.3-100% homologies for VP1, VP2 and VP3 proteins, respectively, indicating high level of genome conservation. Further, placement of critical nucleotides and amino acids at particular positions indicated that Anand CAV is possibly of more pathogenic potential. The CAV isolates were phylogenetically grouped together independent of their geographic origin.
