Sequence Analysis and Phylogenetic Profiling of the Nonstructural (NS) Genes of H9N2 Influenza A Viruses Isolated in Iran during 1998-2007

اولين گزارش شيوع ويروس آنفلوآنزادر گله هاي طيور ايران مربوط به سال 1998 مي باشد. درصد مرگ و مير بالا و كاهش شديد توليد تخم مرغ از عوارض اقتصادي است كه به ويروس آنفلوآنزا سويه H9N2 نسبت داده مي شود. در مطالعه حاضر ژن NS ده نمونه ويروس آنفلوانزا طيور سويه H9N2 كه طي سال هاي 1386-1377 از استانهاي مختلف ايران جدا شده بودند بطور كامل از نظر توالي اسيدهاي آمينه و نوكلييك وفيلوژني مورد تجزيه و تحليل قرار گرفتند. نتايج نشان داد كه تمام اين ويروسها متعلق به آلل A هستند و تحت تيپ ويروس كره اي A/Chicken/Korea/38349-p96323/96 به دو گروه مجزا تقسيم مي شوند. ميزان همولوژي ژن NS در بين نمونه هاي مورد مطالعه از 7/98-6/91 درصد متغير بوده است. موتيف شناساگر ليگاند PDZ در ويروسهاي گروه اول اين مطالعه EDEV (N=6) و يا (N=1) ESEV بود در حاليكه موتيف شناساگر ليگاند PDZ ويروسهاي گروه دوم KSEV (N=3) بود. مطالعه حاضر اطلاعات مولكولار اپيدميولوژيك بسيار مفيدي در رابطه با مسير تكاملي و منشا ويروسهاي آنفلوآنزا كه در طي سالهاي 1377 تا 1386 در مرغداريهاي ايران در گردش بودند را در اختيار ما قرار مي دهد.

The earliest evidences on circulation of Avian Influenza (AI) virus on the Iranian poultry farms date back to 1998. Great economic losses through dramatic drop in egg production and high mortality rates are characteristically attributed to H9N2 AI virus. In the present work non-structural (NS) genes of 10 Iranian H9N2 chicken AI viruses collected during 1998-2007 were fully sequenced and subjected to a phylogenetic analysis. The observations proved allele A was the single-detectable type of the NS gene within the studied isolates. All the examined Iranian isolates fell into the Korean sublineage with a relatively broad sequence homology (91.6-98%) in nucleotide construction of the NS genes. The motif for PDZ ligand recognition of the group one isolates was either EDEV (N=6) or ESEV (N=1) While all viruses as group two contained a PL motif “KSEV” (N=3). The present work provides useful epidemiological data at molecular level on source and contemporary evolution of H9N2 virus population in Iran.