Phylogenetic analysis of PB2 gene of H9N2 subtype of avian influenza viruses isolated from commercial chickens in Tehran province of Iran during 1998-2001

پروتئين PB2 ويروس‌هاي آنفلوانزاي A نقش مهمي در تعيين طيف ميزباني آن‌ها دارد. در اين مطالعه بخشي از ژن PB2 ويروس‌هاي آنفلوانزاي H9N2 جدا شده از جوجه مرغ‌هاي تجاري در استان تهران تكثير و توالي نوكلئوتيدي و اسيد آمينه‌اي آن‌ها تعيين گرديدند. تجزيه و تحليل و مطالعه شجره‌شناسي اين توالي‌ها و مقايسه آن‌ها با برخي توالي‌هاي موجود در بانك جهاني ژن از ويروس‌هاي H9N2 انجام گرديد. مطالعه شجره‌شناسي به روي توالي‌هاي ژن PB2 استفاده شده در اين مطالعه نشان مي‌دهد كه جدايه‌هاي H9N2 ايران را مي‌توان در دودمان اروپايي-آسيايي طبقه‌بندي نمود؛ همان طوري كه بر اساس نتايج حاصل از مطالعه‌هاي انجام شده به روي ژن HA نيز مشخص شده است. در پروتئين PB2 جدايه‌هاي H9N2 ايران در اين مطالعه در محل 621 گلوتاميك اسيد، در 701 آسپارتيك اسيد و در 714 سرين قرار دارد. وضعيت مشابهي در مورد تحت تيپ‌هاي مختلف جدا شده از گونه‌هاي پرندگان در سطح دنيا نشان داده شده است. منشاء ژن PB2 جدايه‌هاي ايراني متفاوت از امارات متحده عربي، پاكستان، عربستان سعودي (كشورهاي خاورميانه) و هند مي‌باشد و احتمال دارد كه اجداد ايزوله‌هاي H9N2 ايراني دچار بازآرايي با ساير تحت تيپ‌ها شده باشند. توالي نوكلئوتيدي ژن PB2 اين پنج جدايه ايراني تشابه بالايي در حدود 5/97% تا 6/99% با يكديگر دارند كه نشان مي‌دهد طي سال‌هاي 1998 تا 2001 جهش‌هاي بسيار كمي در آن‌ها رخ داده است. مطالعه ژن PB2 در جدايه‌هاي سال‌هاي اخير از ساير استان‌ها جهت بررسي تغييرات ممكن در آن و نيز مطالعه بيماري‌زايي جدايه‌هاي ايراني در ميزبان پستاندار قابل توصيه مي‌باشد.

The PB2 protein of influenza A viruses has been shown as host range determinant. In this study PB2 gene of five H9N2 isolates from Tehran province during the period of 1998-2001 were partially amplified and sequenced to do phylogenetic study. Iranian isolates could be classified in Eurasian lineage according to their PB2 gene sequences. The PB2 genes of these isolates are different from those of Middle-East countries such as the UAE, Pakistan and Saudi Arabia, as well as India, and it is probable that their ancestors have undergone reassortment with other subtypes. The Nucleotide sequences of their PB2 are highly similar to each other with 97.5-99.6% homology percentage showing the least mutations in their genes during the period of 1998 to 2001. The PB2 of the Iranian isolates contain Glutamic acid-(E) in position 627, Aspartic acid-(D) in 701 and Serine-(S) in 714 as other avian isolates.