Author/Authors :
Vakili Azghandi، M. نويسنده Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran. , , Nassiri، M. R. نويسنده Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran. , , Shamsa، A. نويسنده Department of Urology, Faculty of Medicine, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran. , , Jalali، M. نويسنده Department of Urology, Faculty of Medicine, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran. , , Shariati، M. M. نويسنده Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran. ,
Abstract :
به منظور بررسي نقش ژن DDX3Y در اسپرماتوژنز و ناباروري گاوهاي نر، نمونه خون 5 راس گاو نر نابارور (فاقد اسپرم) شناسايي شده در مركز اصلاح نژاد كرج جمع آوري شد. پرايمرهاي توصيه شده توسط اتحاديه آكادمي اندرولوژي و شبكه كيفيت مولكولي اروپا (EAA/EQMN) براي شناسايي STS ماركرها با استفاده از نرم افزار BLASTn مورد بررسي قرار گرفت. همچنين همرديف سازي ژن هاي STS ماركرها با ژنوم گاو انجام شد و به منظور طراحي پرايمر مشترك براي ژن DDX3Y گاو و انسان از نرم افزار Primer Primer 5 و نرم افزار CLCWorkbenche 5.5 استفاده شد. پس از انجام مطالعات بيوانفورماتيك، غربالگري مولكولي بر روي DNA ژنومي خون محيطي با هدف شناسايي حذف ژن DDX3Y در كروموزوم Y با استفاده از تكنيك PCR صورت گرفت. آناليز بيوانفورماتيكي اتصال پرايمرهاي انساني STS ماركرها نشان داد كه هيچ شانس اتصال و توليد قطعه هدف براي نمونه هاي گاوي وجود ندارد. بررسي ژن DDX3Y بر روي نمونه هاي گاو بارور نشان داد كه آغازگر طراحي شده به خوبي مي تواند ژن هدف را تكثير سازد. نتايج نشان داد كه 3 گاو حذف جزيي را در ژن DDX3Y داشتند كه علت ناباروري آن ها بود. ژن DDX3Y مي تواند ماركري ارزشمند در تشخيص ناباروري گوساله هاي نر جوان باشد.
Abstract :
To determine the role of DDX3Y gene in spermatogenesis and infertility in bulls, blood samples were collected from five infertile bulls (azoospermic; no sperm in the semen) at the Animal Breeding Center in Karaj, Iran. The recommended human primers by EAA/EQMN were investigated using the BLASTn database for STS marker detection. Alignment of STS marker genes with bovine genome was performed. Primer Premier 5 and CLC Main Workbench 5.5 softwares were used in designing common primer for the bovine and human DDX3Y gene. Genomic DNA screening of peripheral blood was conducted for detection of DDX3Y gene deletion in the Y chromosome by the PCR method. The bioinformatics analysis of human binding-primers of STS markers indicated that there was no chance connection and target fragment production for bovine samples. Investigation of DDX3Y gene on fertile bovine samples showed that the designed primer could detect the target gene as well. The results showed that three bulls had partial deletion in DDX3Y gene as a cause of their infertility. In conclusion, the DDX3Y gene can be a valuable marker to detect infertility in young male calves.
