Title of article :
MICROSATELLITE ANALYSIS OF GENETIC DIVERSITY OF WILD BARLEY (HORDEUM VULGARE SUBSP. SPONTANEUM) USING DIFFERENT SAMPLING METHODS IN IRAN
Author/Authors :
خداياري، حامد نويسنده استاديار گروه زيست شناسي دانشكده علوم پايه , , سعيدي، حجت اله نويسنده دانشيار گروه زيست شناسي دانشكده علوم , , اخوان، آزاده نويسنده گروه زيست شناسي دانشكده علوم , , پورخيرانديش، محمد نويسنده , , كوماتسودا، تاكائو نويسنده استاد موسسه نياس (NIAS)، تسوكوبا ,
Issue Information :
سالنامه با شماره پیاپی 39 سال 2014
Abstract :
الگوي تنوع ژنتيكي 54 جمعيت و 40 فرد جو خودرو از رويشگاههاي طبيعي مختلف ايران با استفاده از 26 جفت نشانگر ريزماهواره مورد آناليز قرار گرفت. در سطح جمعيتي، مقادير بالايي از تنوع (0.71) با متوسط تعداد آلل 6.92 آلل در هر لوكوس (تا 17 آلل در هر لوكوس) وميزان بالايي از پلي مورفيسم به ميزان متوسط 0.67 مشاهده گرديد. تعداد متوسط آلل در هر جمعيت 38.37 (از 36.33 آلل در شمال شرق تا 38.94 آلل در غرب كشور) و در افراد 28.42 آلل در هر فرد (در دامنه ي 28.11 در غرب كشور تا 29 آلل در شمال كشور) بود. در دندروگرامها، نمونه هاي جمع آوري شده از شمال وشمال شرق ايران در يك گروه و دور از نمونه هاي جمع آوري شده از غرب و شمال غرب قرار گرفتند كه بيانگر وجود دو زيرخزانه ژني مخلف در ايران مي باشد. براساس نتايج اين مطالعه، خزانه ژني جو خودرو ايراني منابع بالايي از تنوع را به نمايش مي گذارد كه براي اصلاحگران نباتات جهت يافتن آلل هاي جديد سودمند مي باشد.
Abstract :
The genetic diversity patterns of 54 natural populations and 40 individuals of wild barley from different localities in Iran were analyzed using 26 microsatellites markers. At population level, high levels of diversity (0.71), with an average number of 6.92 alleles per locus (ranging up to 17) and high level polymorphism with polymorphism rate averaging 0.67 were observed. Average number of alleles was 38.37 per population (ranged from 36.33 in the Northeast to 38.94 in the West) and 28.42 per individual (ranged from 28.11 in the West to 29 in the North). In dendrograms, accessions collected from the North and Northeast of Iran were grouped away from those collected from the West and Northwest, suggesting the presence of two different wild barley sub genepools in this country. The genetic diversity decreases from the West toward the East. Based on the results of this study the wild Iranian gene pool of barley represents high level of diversity and there is value to search for new useful alleles to incorporate to the breeding programs.
Journal title :
Iranian Journal of Botany
Journal title :
Iranian Journal of Botany