PHYLOGENETIC ANALYSIS AMONG FOUR SECTIONS OF THE GENUS DENDROBIUM SW. (ORCHIDACEAE) BASED ON LOW COPY NUCLEAR GENE (XDH) SEQUENCES IN PENINSULAR MALAYSIA

در مطالعه حاضر با استفاده ازتوالي ژن هسته اي Xdh بازسازي فيلوژني چهار بخشه از جنس Dendrobium متعلق به تيره گياهي Orchidaceae با روشهاي بيشينه صرفه جويي، درست نمايي حداكثر و بيسين صورت گرفته است. ژن هاي هسته اي با نسخه كم براي مطالعات فيلوژنتيكي مورد استفاده قرار مي گيرند. اين ژن ها داراي مقادير زيادي از اطلاعات ژنتيكي و توارثي از هر دو والد مي باشند. مطالعات مورفولوژيكي در ارتباط با مونوفيلي چهار بخشه (Aporum, Crumenata, Strongyle and Bolbidium) قابل استناد نمي باشد. لذا براي دستيابي به اطلاعات دقيقتر نياز به مطالعات مولكولي مي باشد. در مطالعه حاضر 20گونه گياهي متعلق به جنس Dendrobium به همراه دو گونه گياهي از جنس Bulbophyllum (section Sestochilus) به عنوان برون گروه مورد بررسي قرار گرفته است. بر پايه نتايج ، توالي نوكليوتيدي همرديف سازي شده داراي 733 جايگاه نوكليوتيدي مي باشد كه از اين تعداد 133جفت باز به لحاظ پارسيموني اطلاعاتي است. آناليز داده ها نشان مي دهد كه ژن هاي هسته اي مي توانند به عنوان يك نشانگر معتبر مولكولي براي مطالعات فيلوژنتيكي خصوصا در ارتباط با اين جنس گياهي مورد استفاده قرار گيرند. با توجه به نتايج به دست آمده ، پيشنهاد مي شود كه بهتر است چهار بخشه به صورت يك بخشه در نظر گرفته شده و بر اساس قوانين بين المللي نامگذاري گياهان به نام بخشه Aporum ناميده شود.

The present study focused on the molecular phylogeny of the four sections (Aporum, Crumenata, Strongyle, and Bolbidium) of the genus Dendrobium SW. (Orchidaceae) based upon low copy nuclear gene, Xanthine Dehydrogenase (Xdh) sequences using maximum parsimony (MP), maximum likelihood (ML) and Bayesian (BI) methods. Single and low copy nuclear genes have been increasingly used in phylogenetic reconstruction because they contain large amounts of genetic information and are biparentally inherited. Classifications based on morphological characters have not been able to clearly divide these four sections and neither do they support their monophyletic origins. Therefore, detailed analysis using molecular data is required to ascertain their status. This study includes 20 species of genus Dendrobium and 2 species from genus Bulbophyllum (section Sestochilus) as outgroup taxa. According to the results, the aligned sequences consisted of 733 nucleotide characters of which 131characters were parsimony informative. The analysis revealed that the nuclear genes can be reliable marker for the phylogenetic study of genus Dendrobium. The results suggested that the four sections are probably best considered as one section instead of four and based on the International Code of Botanical Nomenclature (ICBN) rules can be named as section Aporum for this new classification.