Comparison of ISSR and AFLP markers in assessing genetic diversity among Nettle (Urtica dioica L.) populations

گزنه (Urtica dioica L.) يكي از گياهان مهم دارويي بوده كه بطور گسترده در استان مازندران (شمال ايران) مي رويد. در مطالعه انجام شده براي اولين بار از نشانگر AFLP و ISSR بمنظور مطالعه چندشكلي ژنتيكي گياه گزنه استان مازندران استفاده شد. از ده آغازگر AFLP و هفده آغازگر ISSR در اين تحقيق استفاده گرديد. از مجموع 830 باند قابل امتيازدهي نشانگر AFLP حدود 21/90 درصد چند شكل بودند. نشانگر ISSR 234 باند توليد كرد كه 181 باند (3/77 درصد) آن چند شكل بودند. ميانگين هتروزيگوسيتي نشانگرهاي AFLP و ISSR به ترتيب 25/0 و 23/0 مشاهده شد. شاخص نشانگر بدست آمده 25/22 براي AFLP و 57/15 براي ISSR محاسبه شد. تعداد خوشه هاي حاصله در هر دو نشانگر برابر بود، اما محل قرار گيري افراد درون خوشه ها متفاوت بود. در مجموع مقايسه اين دونشانگر نشان داد كه نشانگر AFLP ابزار مناسب تري براي بررسي تنوع U. dioica مي باشد.

Nettle (Urtica dioica L.) is an important medicinal plant which is widely distributed in Mazandaran province North of Iran. In this study, Ampli?ed Fragment Length Polymorphism (AFLP) and Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) markers were used for detection of genetic polymorphism in Mazandaran nettle. Ten AFLP primer combinations and seventeen ISSR markers were utilized. AFLP produced 830 scorable bands out of which 90.21% were polymorphic. ISSR primers ampli?ed 234 bands out of which 181 bands were being polymorphic (77.3%) and average heterozygosity for AFLP and ISSR markers were 0.25 and 0.23, respectively. Marker Index obtains 22.25 for AFLP and 15.57 for ISSR. The number of clusters computed was the same for both molecular markers, with different sample composition. In total, the comparison of two marker systems showed AFLP marker can be useful tool for detection of U. dioica genetic diversity.