اولين گزارش تعيين ژنوتيپ MIRU-VNTR جدايه‌هاي مايكوباكتريوم اويوم تحت گونه پاراتوبركولوزيس از مصر

مايكوباكتريوم اويوم تحت گونه پاراتوبركولوزيس (MAP) عامل مسبب بيماري يون، بيماري مهم اقتصادي در نشخواركنندگان سراسر دنيا مي‌باشد. عامل بيماري در مصر براي اولين بار در سال 2005 جدا شد. از آن پس، پاتوژن در استان‌هاي مختلف مصر شناسايي شد. به منظور رديابي منبع عفونت، تعيين ژنوتيپ با استفاده از روش‌هاي ساده با قدرت تفكيك و تمايز بالا از قبيل تعداد متغير تكراري‌هاي پشت سر هم واحد تكراري پراكنده مايكوباكتريايي (MIRUVNTR) در كشورهاي مختلف انجام شدند. تاكنون اطلاعات منتشر شده‌اي راجع به تعيين ژنوتيپ MIRUVNTR جدايه‌هاي MAP در مصر وجود ندارد. به منظور پرداختن به اين موضوع، 100 نمونه مدفوع از سه مزرعه پرورش شيري مشكوك مختلف جمع‌آوري و كشت داده شدند. 14 جدايه متعلق به يك مزرعه به عنوان MAP شناسايي شدند و تعيين ژنوتيپ با استفاده از واكنش زنجيره‌اي پليمراز هشت جايگاه مختلف MIRUVNTR انجام شد. دو ژنوتيپ مختلف بر اساس پلي‌مورفيسم اندازه‌اي در يك جايگاه (VNTR7) شناسايي شدند كه با تعيين توالي تاييد شد. كار ما پايه اوليه ساخت پايگاه اطلاعاتي تعيين ژنوتيپ MRIRVNTR باكتري MAP را در مصر فراهم مي‌كند.

Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) is the causative agent of Johne’s disease, an economically important disease in ruminants worldwide. It was first isolated in Egypt in 2005. Since then, the pathogen has been detected in different Egyptian provinces. In order to trace the source of infection, genotyping using simple methods of high discriminatory power such as mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeats (MIRU-VNTR) were carried out in different countries. Until now there is no published information about MIRU-VNTR genotyping of MAP isolates in Egypt. To address that point, 100 faecal samples were collected and cultivated from 3 different suspected dairy farms. Fourteen isolates belonging to one farm were identified as MAP and subjected to genotyping using 8 different MIRU-VNTR loci PCRs. Two different genotypes were recognized based on size polymorphism observed in one locus (VNTR-7) that was confirmed by sequencing. Our work provides a preliminary basis of constructing a MIRU-VNTR genotyping database of MAP in Egypt.