Other language title :
Genetic Characterization of Hamra Goat Population in Two Different Locations of Morocco Using Microsatellite Markers
Title of article :
تعيين خصوصيات ژنتيكي جمعيت بز هامرا در دو منطقه مختلف موروكو با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره
Author/Authors :
Hilal، B. نويسنده Department of Animal Production and Biotechnology,Institut Agronomique et Vétérinaire Hassan II,Rabat,Morocco هيلال, ب. , Boujenane، I. نويسنده Department of Animal Production and Biotechnology,Institut Agronomique et Vétérinaire Hassan II,Rabat,Morocco بوجنانه, آي. , El Otmani، S. نويسنده Regional Centre of Tangier,Institut National de la Recherche Agronomique,Tanger,Morocco ال اوتماني, اس. , Chentouf، M. نويسنده Regional Centre of Tangier,Institut National de la Recherche Agronomique,Tanger,Morocco چنتوف, م. , Piro، M. نويسنده Department of Medecine, Surgery and Reproduction, Laboratoire d’Analyses Génétiques Vétérinaires,Institut Agronomique et Vétérinaire Hassan II,Rabat,Morocco پيرو, م.
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی سال 2016
Pages :
7
From page :
901
To page :
907
Abstract :
در اين مطالعه، تنوع ژنتيكي دو جمعيت مختلف نژاد بز هامرا در موروكو روي 60 نمونه مختلف (30 نمونه از منطقه بِني­آروس و 30 نمونه از منطقه روماني) با استفاده از 15 نشانگر ريزماهواره مورد مطالعه قرار گرفته است. مجموعاً 145 آلل شناسايي گرديد و تعداد متوسط آلل به ازاي هر جايگاه، 67/8 و 07/8 آلل به ترتيب در بزهاي منطقه بِني­آروس و منطقه روماني بوده است. شاخص اطلاعات شانون بين 58/1 در بزهاي روماني تا 66/1 در بزهاي بِني­آروس متغير بود. ميانگين هتروزيگوسيتي مورد انتظار و مشاهده شده كُل جايگاه­ها از 62/0 تا 72/0 در بزهاي روماني و 64/0 تا 75/0 در بزهاي بِني­آروس متغير بود. شش نشانگر در بزهاي بِني­آروس و پنج نشانگر در بزهاي روماني انحراف معني­دار از تعادل هاردي واينبرگ نشان دادند. مقادير FIS براي بزهاي بِني­آروس و روماني به ترتيب 110/0 و 108/0 بود. مقادير FST حاكي از وجود مقادير اندك تمايز ژنتيكي بين دو گروه بز مزبور بوده است. فاصله ژنتيكي نِي بين دو گروه 046/0 بوده و نشان دهنده پايين بودن تمايز ژنتيكي است. آناليز واريانس مولكولي (AMOVA) نيز مويد اين موضوع بوده و نشان مي­دهد كه 15/99 درصد از تنوع در داخل گروه­هاي ژنتيكي توزيع گرديده است. حضور دو خوشه (2=K) براي نشانگرهاي ريزماهواره نشان دهنده سطح بالاي اختلاط اين دو جمعيت است. از نتايج حاصل اينطور نتيجه­گيري مي­شود كه هر دو گروه (بِني­آروس و روماني) از شباهت بالايي برخوردار بوده و مي­توان آنها را متعلق به يك جمعيت تلقي نمود.
Abstract :
In this study, genetic diversity of two different populations of Hamra goat breed of Morocco was investigated in 60 different samples (including 30 from Beni Arouss and 30 from Rommani) using fifteen microsatellite markers. A total of 145 alleles were detected with average number per locus of 8.67 and 8.07 in Beni Arouss and Rommani goats, respectively. The Shannon’s information index ranged from 1.58 in Rommani goats to 1.66 in Beni Arouss goats. The expected and the observed heterozygosity average over loci varied from 0.62 to 0.72 in Rommani and from 0.64 to 0.75 in Beni Arouss goats. Six markers in Beni Arouss goats and five in Rommani goats showed a significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium. The FIS values were 0.110 and 0.108 for Beni Arouss and Rommani goats, respectively. A low genetic differentiation was indicated by FST values across the two goat groups. The genetic distance of Nei between the two groups was 0.046 indicating a low genetic differentiation. This was confirmed by the analysis of molecular variance (AMOVA) that showed that 99.15% of variation was distributed within genetic groups. The presence of two clusters (K=2) for microsatellite markers suggested a high level of population admixture. It was concluded that both groups (Beni Arouss and Romani) presented a high similarity and may be considered as belonging to the same population.
Keywords :
genetic diversity , Hamra goat , Microsatellite marker , Morocco
Journal title :
Iranian Journal of Applied Animal Science
Journal title :
Iranian Journal of Applied Animal Science
Record number :
2400479
Link To Document :
بازگشت