Other language title :
Molecular Characterization of Iraqi Local Goat Breeds Using Random Amplified Polymorphic DNA Markers
Title of article :
تعيين خصوصيات مولكولي نژادهاي بز بومي عراق با استفاده از نشانگرهاي RAPD
Author/Authors :
Muhammad Salih Al-Barzinj، Y. نويسنده College of Agriculture,Department of Animal Resources,University of Salahaddin,Erbil,Iraq , , Asmat Oramari، R. نويسنده Faculty of Agriculture,Department of Animal Production,University of Duhok,Duhok,Iraq اسمات اوراماري, ر. , Abdulghany Al-Sanjury، R. نويسنده College of Veterinary,Department of Animal Science,University of Mosul,Mosul,Iraq عبد الغني ال-سنجوري, ر.
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی سال 2016
Abstract :
كشمير تنها توسط نژاد بز مرخز (مرز يا كردي) در ناحيه كردستان عراق توليد ميشود. هدف از اين مطالعه بررسي تنوع ژنتيكي تيپهاي رنگي مرخز، بز سياه و نژادهاي شامي با استفاده از نشانگرهاي RAPD بود. 14 آغازگر استفاده شده و 9 نشانگر از بين آنها بر مبناي تعداد نوارها (NB) و خصوصيات چندشكلي انتخاب گرديدند. اين نشانگرها 154 نوار در محدوده 100 تا 2800 جفت باز توليد كردند. در بين كل نوارها، تنها 50 نوار چند شكل تشخيص داده شدند. 13 نوار منحصر به فرد در بز مرخز شناسايي گرديده و بيشترين تعداد نوارهاي منحصر به فرد نيز در آغازگر ژنگاه 7MO2 به دست آمد. تنوع ژني كُل نِي (تنوع ژني تقسيم بر هتروزيگوسيتي) به طور متوسط 40/0 بود. ولي شاخص تنوع شانون برابر با 58/0 (بين 45/0 تا 69/0) بود. در درختان تبارنما سه خوشه مشاهده گرديد. خوشه اول شامل نژاد بز سياه و خوشه دوم شامل نژاد بز شامي با بز سياه و بز مرخز قهوهاي روشن بود. خوشه سوم نيز شامل بزهاي مرخز سفيد و قهوهاي تيره گرديد. تيپهاي رنگي مرخز در يك خوشه كه حاوي تيپهاي سفيد و قهوهاي تيره بودند گروهبندي گرديده و تيپهاي سياه با قهوهاي روشن در خوشه ديگري قرار گرفتند. اين نتايج نشان ميدهند كه نژاد بز مرخز قرابت بيشتري با بز شامي در مقايسه با نژاد بز سياه دارد.
Abstract :
Cashmere is only produced from Maraz (Kurdi) goat breed in Iraqi Kurdistan Region. The objective of this study was to assess the genetic diversity of different Maraz color types, black goat and Shami breeds using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Fourteen primers were used and nine out of them were selected based on their number of bands (NB) and polymorphic characteristics. These primers generated a total of 154 bands ranged from 100 to 2800 bp. Out of the total bands detected only 50 bands were found to be polymorphic. Thirteen unique bands were found in Maraz goat, whereas the highest unique band was obtained in primer 7-MO2 locus. The overall Nei’s gene diversity (gene diversity/heterozygosity) averaged 0.40, while the Shannon diversity index value was 0.58 ranged from 0.45 to 0.69. Phylogenetic dendrograms showed that three clusters, the 1^st cluster branch consisted of the black goat breed, the 2^nd cluster includes Shami goat with both black and light brown Maraz goat. The 3^rd cluster includes both white and dark brown Maraz goats. Maraz color types grouped in one cluster that contains white and dark brown types and the black with light brown types were included in another cluster. It was concluded that the Maraz goat breed was closer to Shami goat than to the black goat breed.
Keywords :
cashmere , black and shami goats , Maraz , genetic diversity
Journal title :
Iranian Journal of Applied Animal Science
Journal title :
Iranian Journal of Applied Animal Science