Other language title
Mitochondrial Diversity and Phylogenetic Structure of Marghoz Goat Population
Title of article
تنوع ميتوكندري و ساختار فيلوژنتيكي جمعيت بز مرخز
Author/Authors
Seyedabadi، H.R. نويسنده Department of Animal Biotechnology,Animal Science Research Institute,Karaj,Iran سيدآبادي, ح.ر. , Pahlevan Afshari، K. نويسنده Department of Animal Science,Islamic Azad University, Abhar Branch,Abhar,Iran پهلوان افشاري, ك. , Abdolmaleki، M. نويسنده Department of Animal Science,Islamic Azad University, Abhar Branch,Abhar,Iran عبدالمالكي, م.
Issue Information
فصلنامه با شماره پیاپی سال 2016
Pages
6
From page
679
To page
684
Abstract
تنوع ميتوكندري و ساختار فيلوژنتيكي جمعيت بز مرخز بر اساس توالي DNA ميتوكندريايي مورد بررسي قرار گرفت. آناليز فيلوژنتيكي بر اساس توالي ناحيه HVR1 ( 968 جفت باز) و بر روي 40 رأس بز مرخز انجام گرفت. نتايج نشان داد كه جمعيت بز مرخز داراي تنوع ژنتيكي بسيار بالا ( ميانگين تنوع هاپلوتيپي 999/0 و تنوع نوكلئوتيدي 022/0) ميباشد. در بين 40 نمونه، 6 هاپلوتيپ مشاهده شد و بزرگترين هاپلوتيپ شامل 15 فرد بود. تمام هاپلوتيپها در هاپلوگروپ C و با فاصله ژنتيكي زياد از ساير جمعيتهاي بز آسيايي قرار گرفتند كه اين بيانگر تنوع ژنتيكي زياد بز مرخز ميباشد. تنوع ژنتيكي بالاي مشاهده شده، در اصلاح نژاد و تعيين استراتژيهاي حفاظت بز مرخز ميتواند مؤثر باشد.
Abstract
The genetic diversity and phylogenetic structure was analyzed in Marghoz goat population by mitochondrial DNA sequences. Phylogenetic analysis was carried out using hyper variable region 1 (968 bp) obtained form 40 animals. Marghoz goat proved to be extremely diverse (average haplotype diversity of 0.999) and the nucleotide diversity values 0.022. A total of 40 Marghoz goats were grouped into six haplotypes and the large majority of haplotypes were present in 15 animals. All Marghoz haplotypes were classified into C haplogroup and revealed remarkably high genetic distances within the population when compared with other Asian goat populations, indicating high genetic variation in the Marghoz goat. These results indicate high-divergence status of the Marghoz goat and will influence breeding and conservation strategies adopted for this breed.
Keywords
Marghoz goat , genetic diversity , MTDNA , phylogenetic
Journal title
Iranian Journal of Applied Animal Science
Journal title
Iranian Journal of Applied Animal Science
Record number
2400514
Link To Document