Other language title :
Fasciola gigantica of Ruminants: The phylogenetic analysis based on COX1 sequences
Title of article :
فاسيولا ژيگانتيكا نشخواركنندگان: تجزيه و تحليل شجرهشناسي بر اساس ترادف COX1
Author/Authors :
Jahani، Z. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine, Center of Excellent of Ecosystem and Ultrastructural Changes of Helminthes,Department of Parasitology,University of Tehran,Tehran,Iran مشگي, بهنام , Meshgi، B. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine, Center of Excellent of Ecosystem and Ultrastructural Changes of Helminthes,Department of Parasitology,University of Tehran,Tehran,Iran جهاني, زهرا , Amininia، N. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine, Center of Excellent of Ecosystem and Ultrastructural Changes of Helminthes,Department of Parasitology,University of Tehran,Tehran,Iran اميني نيا, نرگس
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی سال 2017
Abstract :
زمينه مطالعه: گونههاي فاسيولا بعنوان ترماتودهاي ديژنهآ با پراكندگي جهاني توصيف شده كه باعث آلوده شدن علفخواران بخصوص نشخواركنندگان ميشوند. هدف از بررسي حاضر تنوع درون گونهاي فاسيولا ژيگانتيكا از دو جدايه بز و گاوميش، مربوط به دو منطقه جغرافيايي ايران بود. روش كار: جمعآوري نمونهها در بررسي كشتارگاهي از دو منطقه تهران و گيلان انجام گرفت. نمونهها بر اساس مشخصات ريختي بصورت اوليه و براساس كليد تشخيص شناسايي گرديد. در بخش مولكولي، واكنش زنجيرهاي پليمراز به منظور تكثير توالي ژن COX1انجام شد و محصول PCR پس از خالصسازي، تعيين توالي گرديد و درخت شجرهايي ترسيم شد. ترادف اسيدهاي آمينه نيز صورت پذيرفت. سپس ترادفهاي حاصل با استفاده از نرم افزارهاي مربوط تحت تجزيه و تحليل قرار گرفتند. نتايج: الگوي PCR در همه جدايهها با وجود باندي به اندازه 499 جفت باز قابل تشخيص بود. نتايج تعيين توالي اسيدهاي آمينه مشخص كرد، بين دو جدايه بز و گاوميش از اين حيث اختلاف وجود دارد. در جدايه بز 4 اسيدآمينه از شماره 135 تا 138 بترتيب شامل لوسين، فنيلآلانين، ترئونين و اسپارتات به سرين، لوسين، هيستيدين و لوسين تغيير پيدا كردهاند. علاوه بر اين در اسيدآمينه شماره 154 جدايه گاوميش لوسين جايگزين سرين شده است. نتيجهگيري نهايي: نتايج بدست آمده نشان داد كه جدايههاي بز و گاوميش ميتوانند مسؤل بقا ابتلا به فاسيولا در مناطق بومي آلودگي باشند. بنظر ميرسد تنوع موجود بين فاسيولا ژيكانتيكا و ميزبان ميتواند منجر به اختلافات زيستي در انگل گردد و لذا رهيافتهاي مناسبي بعنوان سياستهاي كنترلي و درماني مورد نياز است.
Abstract :
BACKGROUND: Fasciola species are parasitic trematode with world wide distribution that infects wild and domesticated herbivores, particularly ruminants. OBJECTIVES: The aim of the present study was to investigate the intra species variations of F. gigantica, from goats and buffalo isolates in two common geographic climates of Iran. METHODS: Fasciola species were collected from goat, buffalo, sheep, and cattle in different regions. Cytochrome c oxidase I (COX1) of mitochondrial DNA (mt-DNA) was amplified from individual trematodes by polymerase chain reaction (PCR), using universal primers, and the amplicons were consequently sequenced and sequencing data were analyzed, using Clutal W software against the GenBank database. RESULTS: A monomorphic DNA segment of approximately 499bp was seen in Fasciola isolates. The results of the amino acid sequence alignment defined strictly conserved amino acid residues in buffalo isolates of F. gigantica and partially conserved residues for goat isolates of F. gigantica. There are four tandem amino-acid replacements in the goat isolates at the position of 135-138, where Leucine (L), F (Phenylalanine), T (Threonine), and D (Aspartate) sequences changed into S (Serine), L (Leucine), H (Histidine), and L (Leucine), respectively. Furthermore, a replacement in the sequence of amino acid was found in isolates from buffalo at the position of 154, where Serine (S) was transformed into Leucine (L). CONCLUSIONS: The findings of our study indicate that the variants of goat and buffalo can be responsible for persistence of Fasciola infection in the endemic areas of Iran. It seems that biological differences could occur by considering a variety of F. gigantica-hosts in Iran. Thus, suitable approaches are required for effective treatments and useful control strategies.
Keywords :
نشخواركنندگان , شجره شناسي , ترادف , cox1 , fasciola gigantica , Sequence , ruminants , phylogenetic , فاسيولا ژيگانتيكا
Journal title :
Iranian Journal of Veterinary Medicine (IJVM)
Journal title :
Iranian Journal of Veterinary Medicine (IJVM)