Other language title :
تجزيه تحليل تنوع و ساختار جمعيتي لوبياي فابا (.Vicia faba L) با استفاده از نشانگر هاي SSR
Title of article :
Diversity and Population Structure Analysis of Faba Bean (Vicia faba L.) Accessions Using SSR Markers
Author/Authors :
Tahir, N.A Department of Horticulture - College of Agricultural Sciences - University of Sulaimani, Iraq , Omer, D.A Ministry of Agriculture - General Directorate of Agriculture, Sulaimani, Iraq , Lateef, D.D Department of Field Crops - College of Agricultural Sciences - University of Sulaimani, Iraq , Ahmad, D.A Department of Field Crops - College of Agricultural Sciences - University of Sulaimani, Iraq , Salih, S.H Department of Field Crops - College of Agricultural Sciences - University of Sulaimani, Iraq , Hiwa Khal, L Department of Horticulture - College of Agricultural Sciences - University of Sulaimani, Iraq
Abstract :
The awareness and conception of the genetic diversity in faba bean (Vicia faba) accessions
are important for the enforcement of degree addressed to their usages and conservations.
The aim of this work was to estimate the genetic diversity and population structure in
Iraqi faba bean using SSR markers for utilization in crossing and variety development.
To assess genetic variation and population structure among faba bean accessions, 25
microsatellite loci were exerted. The analysis of diversity indices in the set of faba bean
accessions examined here showed that the microsatellites were informative for genotype
characterization. In total, 72 polymorphic alleles were exposed to an average of 2.88 per
locus and three unique alleles were detected. The average of PIC, gene diversity, marker
index, resolving power and Shannon diversity was 0.513, 0.569, 1.671, 2.173 and 0.830,
respectively. The patterns detected in the dendrogram and PCA divided 19 accessions into
five distinct clusters with different levels of sub-grouping within the cluster. High-level
genetic differentiation within a population or group (83%) was significantly greater than
that among groups or populations (17%), as planned by Analysis Of Molecular Variance
(AMOVA). The model of clustering, based on the analysis of STRUCTURE software,
identified four groups genetically dispersed. These findings have additional importance in
faba bean breeding as well as maintenance programs.
Farsi abstract :
آگاهي و درك مفهوم تنوع ژنتيكي نمونه هاي ثبت شده لوبياي فابا (Vicia faba) براي اعمال درجه بندي در مصرف و حفاظت آنها مهم است. هدف اين پژوهش تخمين تنوع ژنتيكي و ساختار جمعيتي لوبياي فابا در عراق با استفاده از نشانگر هاي SSR براي كاربرد در تلاقي و توليد ارقام بود. به منظور ارزيابي تغييرات ژنتيكي و ساختار جمعيتي در ميان نمونه هاي ثبت شده لوبياي فابا، 25 مكان ژني ريزماهواره اعمال شد. تجزيه شاخص هاي تنوع در مجموعه لوبيا فابا هاي بررسي شده در اين مطالعه نشان داد كه ريز ماهواره ها براي مشخص كردن ژنوتيپ ها مفيد و آموزنده بودند. در كل، 72 آئل پلي مورفيك به طور ميانگين در معرض 2/88 مكان ژني قرار داده شد و 3 آلل منحصر به فرد تشخيص داده شد. ميانگين PIC، تنوع ژنتيكي، شاخص نشانگر، resolving power و تنوع شانون، به ترتيب برابر بود با 0/513، 0/569، 1/671، 2/173، و 1/83. الگوهاي شناسايي شده در دندرو گرام و تجزيه به مولفه هاي اصليPCA)، 19) نمونه ثبت شده را به 5 خوشه متمايز دسته بندي كرد كه هر خوشه زير - گروه بندي متفاوتي داشت. همان گونه كه طبق تجزيه واريانس ملكولي (AMOVA) برنامه ريزي شده بود، تمايز ژنتيكي در سطح بالا در درون يك جامعه يا گروه (83٪) به طور معناداري بيشتر از تمايز بين گروه ها يا جامعه ها (17٪) بود. مدل خوشه بندي بر مبناي تجزيه نرم افزار STRUCTURE
چهار گروه را كه از نظر ژنتيكي پراكنده بودند شناسايي كرد. اين يافته ها در برنامه هاي بهنژادي و نگهداري لوبياي فابا مورد استفاده دارند.
Keywords :
Microsatellites , Legume , Genetic structure , Genetic variation indices , Genetic variation indices