Molecular analysis of the nucleocapsid gene and 3ʹʹ untranslated region of two infectious Bronchitis Virus field isolates from Iranian poultry farms

برونشيت عفوني يك بيماري مهم از نظر اقتصادي در ماكيان مي باشد. به دليل ظهور واريانتهاي جديد ويروس برونشيت عفوني، كنترل اين بيماري بعنوان يك مشكل جدي در صنعت طيور در دنيا مطرح است. در مطالعه حاضر، ژن نوكليوكپسيد (N) و ناحيه غيرترجمه شده انتهايي 3’ (UTR) دو جدايه ويروس برونشيت عفوني از مرغداريهاي ايران تعيين توالي گرديد و با ساير سويه هاي ويروس مقايسه گرديدند. تواليهاي نوكليوتيدي ژن N و ناحيه 3’UTR جدايه هاي ويروس برونشيت ايران داراي تشابه 90 درصدي با سويه هاي واكسني مورد استفاده در مرغداريهاي ايران شامل H52 و H120 بودند. اما براساس آناليزهاي فيلوژنتيكي، جدايه هاي ويروسي ايران در گروهي مجزا از سويه هاي واكسني مورد استفاده در ايران و نيز سويه هاي جدا شده در چين، استراليا و امريكا قرار گرفتند. با توجه به نتايج بدست آمده مشخص گرديد كه ويروسهاي برونشيت عفوني در گردش در مرغداريهاي ايران از نظر ژنتيكي از سويه هاي واكسني ويروس كه سالها است در مرغداريهاي ايران استفاده مي شوند مجزا مي باشند. بنابراين تهيه يك واكسن جديد بر اساس سويه هاي در گردش ويروس براي كنترل بيماري در مرغداريهاي ايران اهميت زيادي دارد

variants of infectious bronchitis virus (IBV), the control of IB has become a serious problem for the poultry industry worldwide. In the present study, the nucleocapsid gene (N) and 3ʹ untranslated region (UTR) of two IBVs isolated from Iranian poultry farms were sequenced and compared with other IBV strains. Based on nucleotide identity, the N gene and 3ʹ UTR sequences of Iranian IBVs showed 90% similarity to the commonly used IBV vaccine strains, H52 and H120. However, based on phylogenetic analyses, Iranian IBVs Infectious bronchitis (IB) is an economically important disease of chickens. Due to the emergence of new were found to cluster separately from the IBV vaccine strains used in Iran as well as other IBVs isolated in China, Australia and the United States. It was concluded that IBVs circulating in Iran are genetically distinct from IBV vaccine strains that have been used in Iran for many years. Therefore, it is important to develop a new vaccine based on these newly identified strains for controlling IB in Iranian poultry farms.