Comparative proteomics analysis of a novel g-radiation-resistant bacterium wild-type Bacillus megaterium strain WHO DQ973298 recovering from 5 KGy g-irradiation

به منظوربررسي بيان پروتيين هاي القايي تحت تاثير تابش گاما درباكتري بسيار مقاوم به پرتو، براي اولين بارآناليز مقايسه اي پروتيوم سوش وحشي باسيلوس مگاتريوم WHO انجام شد.تفاوت درپروفايل پروتييني باسيلوس مگاتريوم WHO بعد از KGy5 پرتودهي بوسيله الكتروفورز دو بعدي ورنگ آميزي نقره بررسي شد.اگر چه بيشتر نقاط پروتييني كا هش بيان را نشان مي دادند ولي در اين مطالعه نقاط پروتييني القا شده مورد نظر ما بودند.سطح بيان 48 پروتيين افزايش معني داري را نشان مي داد كه از اين تعداد 45 پروتيين به وسيله تكنيك انگشت نگاري جرم پپتيدي MALDI TOF-TOF (peptide mass fingerprinting using matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry) بعداز هضم آنزيمي ،شناسايي شدند.اين پروتيينها انواع اعمال بيولوژيكي جالبي را ارايه مي دهندو به گروه هاي زير تقسيم مي شوند:1-نسخه برداري2-ترجمه3- سيگنال القايي4-متابوليسم و انتقال كربوهيدراتها5-توليد انرژي 6-متابوليسم و انتقال نوكليوتيدها7-تغييرات بعد از ترجمه،protein turn overوچپرون ها8 -همانند سازي، نوتركيبي وترميمDNA 9-پروتيين هاي مربوط به استرس عمومي در باكتري ها 10- پروتيين هايي كه شناخته نشده اند .ظهور چهار نقطه(24،27،30،37) از پروفايل پروتييني باكتري در مطالعه پيش رو متمايز بود.اين پروتيين ها بيان مي شوند تا جريان هاي مربوط به مقاومت به پرتو را ميانجيگري كنند و به وضوح نشان دهنده اين است كه به طور مشخصي باسيلوس مگا تريوم WHO داراي مكانيسم مقاومت به تابش گاما مي باشد.

In order to examine radiation-induced proteins in an extremely radio-resistant bacterium, it became possible to perform comparative proteomic analysis on radio-resistance Bacillus megaterium WHO as a wild-type strain. Variation in cellular proteins profiles of the Bacillus megaterium WHO after 5 KGy g-irradiation were analyzed by two-dimensional poly acryl amide gel electrophoresis and silver staining. Although many spots were decreased in density, our primary focus was on the induced spots. The expression level of 48 protein spots showed significant increase under radiation stress. Of these spots, 45 were identified with MALDI TOF-TOF (peptide mass fingerprinting using matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry) after tryptic in-gel digestion. These proteins exhibited various interesting cellular functions including: (i) transcription (ii) translation (iii) signal transduction (iv) carbohydrate transport and metabolism (v) energy production and conversion (vi) nucleotide transport and metabolism (vii) posttranslational modification, protein turnover and chaperones (viii) DNA replication, recombination and repair (ix) bacterial general stress response and (iix) different and some still unknown functions. The appearance of four spots (24, 27, 30 and 36) in response to g-irradiation was the distinct result of present study. These proteins appear to mediate processes related to ionizing radiation resistance and clearly demonstrate that Bacillus megaterium WHO, significantly has mechanisms contribute to the ionizing radiation resistance.