Title of article :
A comparative phylogenetic analysis of Theileria spp. by using two "18S ribosomal RNA" and "Theileria annulata merozoite surface antigen" gene sequences
Author/Authors :
غلامرضا، حبيبي نويسنده Department of Parasite Vaccine Research and Production, Razi Vaccine & Serum Research Institute, Karaj, Iran G., Habibi
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی - سال 2013
Abstract :
بيش از 185 گونه و سويه تيلريا در تاكسونومي Entrez معرفي شده است. شناسايي دقيق عامل مولد در شناخت اپيدميولوژي، پيشگيري و درمان مناسب اهميت دارد. هدف از اين مقاله بحث در مورد اهميت دو ژن Theileria annulata يكي ژن مربوط به تحت واحد كوچك ريبوزومي 18S rRNA و دوم ژن مربوط به آنتي ژن سطحي مروزوايت تيلريا آنولاتا (Tams1) در تجزيه و تحليل فيلوژني داده هاي مولكولي است. هشت جدايه Theileria annulata شامل سويه واكسن ايران S15، شش جدايه صحرايي T. annulata و يك جدايه T. annulata تهيه شده از كشور عراق در اين مطالعه مورد بررسي قرار گرفت. تجزيه و تحليل فيلوژني پس از استخراج DNA، انجام واكنش زنجيرهاي پليمراز و تعيين توالي قطعات حاصله انجام گرفت. قطعات بطول 1410 تا 1412 از ژن كامل 18S rRNA و 778 نوكليوتيدي از ژن Tams1 در تحليل تنوع نوكلوتيدي مورد استفاده قرار گرفت. مقايسه توالي ها براي آناليز فيلوژني با ترسيم درخت فيلوژني و ماتريكس تشابهات توالي ها بر اساس دو ژن فوق انجام شد. نتايج اين مطالعه نشان داد، كه فقط ژن 18S rRNA در پيشگويي و برآورد ارتباط ميان گونه هاي Theileria معني دار بوده، اما ژن Tams1 در تجزيه و تحليل ملكولي تنوع آنتي ژني در توسعه واكسن مي تواند مورد استفاده قرار گيرد.
Abstract :
More than 185 species, strains and unclassified Theileria parasites are categorized in the Entrez Taxonomy.
The accurate diagnosis and proper identification of the causative agents are important for understanding the
epidemiology, prevention and appropriate treatment. This study aims to discuss the importance of two
genes of Theileria annulata 18S ribosomal RNA (18S rRNA) and Theileria annulata merozoite surface
antigen (Tams1) for phylogenetic analysis of molecular data. Eight Theileria annulata isolates including
S15 Iran vaccine strain, six T. annulata field isolates and one Iraq T. annulata field isolate were studied in
this study. The 18S rRNA and Tams1 gene sequences were investigated by phylogenetic analysis after
DNA extraction, PCR, and DNA sequencing. Sequence fragments of about 1410 to 1412 bp of the
complete 18S rRNA gene and 778 nucleotides of Tams1 gene sequences were used in the analysis of
nucleotide diversity. Sequence alignment and phylogenetic analysis were performed by constructing the
phylogenetic tree and identity matrix based on two above genes. The results of the study revealed, the 18S
rRNA is informative in estimation of relationships among Theileria species and strains, but the Tams1
seems to be appropriate for analysis of the molecular antigenicity in vaccine development.
Journal title :
Archives of Razi Institute
Journal title :
Archives of Razi Institute