عنوان :
بررسي جمعيت شناسي ميگوي سفيد Metapenaeus affinis در سواحل شمالي خليج فارس
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
تمدني، جهرمي، سعيد
شناسه هاي افزوده :
رضواني گيل كلايي، سهراب ، همكار طرح , غرقي، احمد ، همكار طرح , صادقي، محمدرضا ، همكار طرح , بصيرت، مرضيه ، همكار طرح , دهقاني، رضا ، همكار طرح , فروغي فرد، حجت اله ، همكار طرح
تنالگان :
وزارت جهاد كشاورزي - سازمان تحقيقات و آموزش كشاورزي - مؤسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور - پژوهشكده اكولوژي خليج فارس و درياي عمان
چكيده فارسي :
ميگوي سر تيز Metapenaeus affinis از مهم ترين گونه هاي ميگوي خانواده پنائيده در خليج فارس است كه پس از گونه ميگوي موزي رتبه دوم صيد را در استان هرمزگان به خود اختصاص مي دهد. با توجه به اهميت ميگوي سر تيز در چرخه صيد و صيادي اين استان، تنوع ژنتيكي و ساختار جمعيتي اين گونه در خليج فارس با استفاده از توالي يابي ژن ميتوكندريايي 16SrRNA براي اولين بار بررسي شد. تعداد 18 عدد ميگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و خوزستان (از هر منطقه 6 نمونه) جمع آوري شد. استخراج DNA با روش فنل-كلروفرم انجام شد و با بهينه سازي واكنش PCR جهت تكثير ژن مذكور، مناسب ترين دما براي اتصال آغازگر دماي 48 درجه سانتيگراد به دست آمد. نتايج توالي يابي ژن 16SrRNA در 18 ميگوي نمونه برداري شده كه شامل 486 باز همرديف شده بود، 480 جايگاه ژني مونومورف، شش جايگاه ژني پلي مورف و دو جايگاه انتقالي نشان داد. هيچ گونه چند شكلي اضافه و حذف مشاهده نشد. تعداد نه هاپلوتيپ از 18 نمونه مورد مطالعه به دست آمد. ميانگين تنوع هاپلوتيپي براي نمونه هاي هر منطقه از 000/0 ± 000/0 (بندرعباس) تا 0/215 ± 0/333 (بوشهر) و 0/215± 0/333 (خوزستان) و ميانگين تنوع نوكلئوتيدي براي نمونه هاي هر منطقه از 000/0 ± 000/0 (بندرعباس) تا 0/003 ± 0/003 (بوشهر) و 0/001± 0/001 (خوزستان) به دست آمد. ميانگين تنوع هاپلوتيپي بين سه منطقه 0/007 ± 0/608 و ميانگين تنوع نوكلئوتيدي 0/003 ± 0/002 محاسبه شد. بيشترين مقدار تمايز جمعيتي محاسبه شده، بين جمعيت بندرعباس و خوزستان (0/750) و كمترين مقدار تمايز جمعيتي هم بين مناطق بوشهر و خوزستان (0/105) به دست آمد. در سطح احتمال 0/05 تفاوت جمعيت ميگوي سر تيز منطقه بندرعباس با دو منطقه بوشهر و خوزستان معني دار بود ولي بين دو منطقه بوشهر و خوزستان با يكديگر معني دار نبود. آزمون تفاوت جمعيت (non-differentiation exact p values) در داخل جمعيت ها در سطح احتمال 0/05 وجود تفاوت بين جمعيت ميگوي سر تيز بندرعباس با دو منطقه ديگر را مورد تأييد قرار داد. درخت هاي تكاملي رسم شده با درصد بالايي جدايي جمعيتي منطقه بندرعباس را از دو منطقه ديگر نشان دادند. نتايج اين بررسي با استفاده از روش توالي يابي ژن 16SrRNA نشان داد كه جمعيت ميگوي سر تيز منطقه بندرعباس يك خزانه ژني مستقل و جداگانه از دو منطقه ديگر مي باشد و عليرغم احتمالاً يكي بودن جمعيت هاي آن در مناطق بوشهر و خوزستان، تنوع مولكولي اين گونه در اين دو منطقه در حد قابل قبول مي باشد.
چكيده انگليسي :
Jinga shrimp Metapenaeus affinis is one of the most important penaeide shrimp species in Persian Gulf that has the highest amount of shrimp catch after banana shrimp in Hormozgan province. Regarding the importance of Jinga shrimp in fisheries of this province, genetic diversity and population structure of this species was assessed for the first time by mitochondrial 16SrRNA sequencing. A number of 18 shrimps were collected from the regions of Bandar Abbas, Bushehr and Khuzestan (six samples each region). DNA Extraction was performed using phenol-chloroform and by optimizing the PCR for amplification of 16SrRNA, the most suitable temperature for primer binding was 48 °C. Analysis of 18 sequenced samples including 486 aligned base pairs of 16SrRNA yielded 480 monomorphic loci, 6 polymorphic loci and 2 transitions. No insertions and deletions were observed. 9 haplotypes were identified from the 18 samples. Mean haplotype diversity in each region was recorded from 0.0 ± 0.0 (Bandar Abbas) to 0.333 ± 0.215 (Bushehr) and 0.333 ± 0.215 (Khuzestan), and mean nucleotide diversity from 0.0 ± 0.0 (Bandar Abbas) to 0.003 ± 0.003 (Bushehr) and 0.001 ± 0.001 (Khuzestan). Haplotype and nucleotide diversity of all samples were 0.608 ± 0.007 and 0.002 ± 0.003, respectively. The maximum amount of F- statistic parameter was 0.750 between samples of Bandar Abbas and Khuzestan and the minimum amount between Bushehr and Khuzestan (-0.105). At probability level of 0.05, population differentiation was significant between Bandar Abbas and two other regions of Bushehr and Khuzestan but not significant between regions of Bushehr and Khuzestan. Test of exact p values within population confirmed the difference of Bandar Abbas population from the two other populations. Phylogenetic trees showed the differentiation of Bandar Abbas population from the two other regions. The results of this study using mitochondrial 16SrRNA sequencing revealed that the Jinga shrimp population of Bandar Abbas is a differentiated and separated gene pool from the two other regions, and although the populations of Bushehr and Khuzestan seem not genetically separated, molecular diversity of this species is acceptable in these two regions.
كليدواژه :
ميگوي سر تيز Metapenaeus , 16SrRNA , خليج فارس , ساختار جمعيت , تعيين توالي
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
بخشي رنگي، جدول، مصور، نمودار
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 49357
كتابنامه :
كتابنامه: ص. 49- 52
موضوع :
ميگوي پاسفيد , ميگوي پاسفيد- ايران- خليج فارس
