عنوان :
ايجاد بانك اطلاعات ژنتيكي ميگوهاي پرورشي و پاتوژن هاي بومي آن در ايران
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
يگانه، وحيد
شناسه هاي افزوده :
افشارنسب، محمد ، همكار طرح , ميربخش؛ مريم ، همكار طرح , تمدني، سعيد ، همكار طرح , قائدنيا، بابك ، همكار طرح , دشتياننسب، عقيل ، همكار طرح , كشتكار، عيسي ، همكار طرح , نظاري، محمدعلي ، همكار طرح , حسيني، مهرداد ، همكار طرح , انصاري، فرخ ، همكار طرح , رضواني، سهراب ، همكار طرح , غريبي، قاسم ، همكار طرح , محمدي باغملايي، عصمت ، همكار طرح , جميلي، شهلا ، همكار طرح , شعباني، محمد جواد ، همكار طرح , خورشيديان، كامبوزيا ، همكار طرح , خليل پذير ، محمد ، همكار طرح
تنالگان :
سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
چكيده فارسي :
خط شناسه DNA و يا باركد-DNA يك توالي بسيار كوتاه استاندارد از يك ژن كاملاً شناخته شده سيتوكروم اكسيداز-1 ميتوكندريايي است. به كمك اين توالي DNA مي‌توان پي برد كه هر جانور، گياه يا قارچ به چه گونه‌اي تعلق دارد. در اين پژوهش از ميگوي پرورشي وارداتي Litopenaeus vannamei و5 گونه ميگوي خليج فارس و درياي عمان كه بر اساس طبقه بندي سيستماتيك سنتي عبارت بودند از: Penaeus semisulcatus، Fenneropenaeus merguiensis ، Metapenaeus affinis ، Parapenaeopsis Stylifera و Fenneropenaeus indicus نمونه برداري شد و پس از انجام آزمايشات مولكولي بر روي توالي باركدDNA ، عمليات بيوانفورماتيكي و آناليز باركد هر توالي در نرم افزار كنسرسيوم خط شناسه گذاري (CBOL) و پايگاه داده هاي بانك جهاني ژن(NCBI) ، طبقه بندي فيلوژنتيك هر نمونه مشخص گرديد و ميزان تشابه هر نمونه با پايگاه داده هايNCBI و CBOL بررسي و نزديك ترين گونه به نمونه مورد بررسي تعيين شد. نتايج نشان دادند كه نمونه هاي L.vannamei گونه باندار P. semisulcatus ، F . merguiensis و F. indicus با نمونه هاي ساير كشورها بيش از 97 درصد مشابهت داشتند. گونه بدون باند P.semisulcatus 09/87 درصد مشابهت با گونه P.semisulcatus باند دار، نمونه M. affinis بيش از 3/90درصد شباهت با Metapenaeus ensis و نمونه 44/93 درصد Parap. Stylifera مشابهت با Parapenaeopsis coromandelica داشت كه در رابطه با گونه هايي كه درصد مشابهت كمتر از 97 درصد مي باشد نياز به بررسي هاي بيشتر و در صورت تاييد امكان اعلام گونه جديد وجود دارد.
چكيده انگليسي :
Abstract:
DNA barcode is a short, standard well known sequence of cytochrome oxidase І gene. By using this DNA sequence can be realized that each animal, plant or fungus belongs to which species. in this research, samples were collected from imported cultured shrimp Litopenaeus vannamei and and 6 Persian Gulf and Oman Sea shrimp species which classified based on traditional systematically as: Penaeus semisulcatus, Fenneropenaeus merguiensis, Metapenaeus affinis, Parapenaeopsis Stylifera and Fenneropenaeus indicus. After examination of DNA barcode sequence, molecular and bioinformatics operations of each sequence in the Consortium for the Barcode of Life (CBOL) and National Center for Biotechnology Information (NCBI), phylogenetic analysis of each sample was determined and similarity of each sample with NCBI and CBOL database was checked and the closest species to each sample were specified. According to the results different samples of L. vannamei, . banded P.semisulcatus, F. merguiensis and F. indicus have more than 97% similarity to the same species of other countries. non banded P.semisulcatus had 80.07% similarity to banded P.semisulcatus, M. affinis samples had 90.3% similarity to Metapenaeus ensis and Parap. Stylifera had 93.44% similarity to Parapenaeopsis coromandelica in the CBOL. This funding confirmed the need for further investigation and possible announcement of new species
كليدواژه :
سفيد هندي , خط شناسه DNA , ميگو , سفيد غربي , ببري سبز , موزي , خنجري , سرتيز
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
بخشي رنگي، جدول، مصور، نمودار
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 50726
كتابنامه :
كتابنامه: ص. 62- 63
