1993

شناسايي مولكولي دوكفه اي بومي تالاب انزلي (آنودونت) با استفاده از توالي يابي ژن سيتوكروم اكسيداز (COI)

سهرابي لنگرودي، تورج

پوركاظمي، محمد همكار طرح , بهمنش، شهرام همكار طرح , قاسمي، محدث همكار طرح , بوراني، محمد صياد همكار طرح , دژنديان، سهراب همكار طرح , چكمه دوز قاسمي، فريدون همكار طرح , محمدپور، قربانعلي همكار طرح , صابري كوچصفهاني، حسين همكار طرح , محمدي تبار، بهمن همكار طرح , گلشن، مهدي همكار طرح

1399

وزارت‌ جهاد كشاورزي‌ - سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور

هدف از مطالعه حاضر شناسايي دقيق گونه اي از صدف دو كفه اي بومي تالاب انزلي موسوم به Anodonta cygnea با استفاده از روش مولكولي توالي يابي و بر اساس بخشي از ژن COI (سيتوكروم اكسيداز وان) ميتوكندريايي و ثبت آن در بانك ژن جهاني مي باشد. بدين منظور پس از نمونه برداري صدف از تالاب انزلي، نمونه ها به آزمايشگاه ژنتيك منتقل شدند و استخراج DNA از بافت تازه آنها انجام شد. كيفيت و كميت DNA هاي استخراج شده با استفاده ازروش هاي الكتروفورز ژل آگارز 1 درصد و اسپكتروفتومتري در طول موج هاي 260 و 280 نانومتر ارزيابي شد. جهت انجام PCR ابتدا يك قطعه از ژن COI ناحيه ميتوكندريايي از بانك ژن NCBI انتخاب و پس از طراحي يك قطعه با اندازه مناسب توسط نرم افزار GeneRunner سنتز گرديد. پس از انجام PCR و اطمينان از تكثير ژن مورد نظر، نمونه هاي تكثير شده توالي يابي شدند. نمونه هاي توالي يابي شده با استفاده از نرم افزارهاي ژنتيكي نظير Mega6 و Chromas تجزيه تحليل شده و پس از بلاست (Blast) بعنوان يك گونه بومي شناسايي شده تالاب انزلي در بانك ژن جهاني NCBI ثبت شدند. با توجه به نتايج بدست آمده از توالي هاي ژن COI و تطبيق نمونه هاي موجود با توالي هاي ثبت شده در بانك ژن مشخص گرديد كه تمامي نمونه ها متعلق به گونه Anodonta anatine بوده است در حالي كه طي دهه هاي گذشته با توجه به شباهت بسيار زياد صدف هاي دوكفه اي آنودونت به يكديگر و فقدان روش هاي نوين ژنتيك مولكولي صدف دو كفه اي تلاب انزلي به اشتباه Anodonta cygnea اطلاق گرديده است.

The aim of this study was to accurate identification of bivalve species of Anzali wetland (Anodonta cygnea ) by using of molecular sequencing method and based on a part of the mitochondrial COI ( cytochrome oxidase one) and gene registeration in Global gene bank. For this purpose, after sampling of baivalves from Anzali wetland, the samples were transferred to the genetic laboratory and DNA extraction from their fresh tissue was done. The quality and quantity of extracted DNA were measured by 1% agarose gel electrophoresis and by spectrophotometric method at 260 and 280 nm wavelengths with nanodrop device. For PCR , a piece of CO1 gene was selected from mitochondrial region of NCBI gene bank and , after designing a suitable size piece, was synthesized by the GeneRunner software. The samples were sequenced amplified after PCR and ensuring the desired gene proliferation. Sequenced samples were analyzed using genetic software such as Mega6 and Chromas. After blast, they were registered as an indigenous species of Anzali wetland at the NCBI world gene Bank. According to the results of the CO1 gene sequences of this project and the matching of existing samples with sequences recorded in the gene bank, it was found that all specimens was belonged to the Anodonta anatine species and ,over the past decades, due to the similarity of Anodont bivalve to each other and the absence of new molecular genetic methods ,it was mistaked to Anodonta cygnea species in Anzali wetland.

صدف آنودونت , تالاب انزلي , سيتو كروم اكسيداز

سهرابي لنگرودي،‌تورج

تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور

مصور، عكس(رنگي)، جدول، نقشه

موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 58173