مرکز منطقه ای اطلاع رساني علوم و فناوري - بررسي تنوع ژنتيكي ويروس كوتولگي زرد جو BYDV-PAV در استان هاي شمالي كشور

چكيده :

در ميان ويروس هاي مختلف عامل بيماري كوتولگي زرد جو و كوتولگي زرد غلات ، بيشترين مطالعه در سراسر جهان به دليل فراواني ، در مورد PAV صورت گرفته است . مطالعات انجام شده در ايران نيز PAV را ويروس غالب اين بيماري نشان داده است اما اطلاعات چنداني از تنوع ژنتيكي آن در دست نمي باشد. در تحقيق حاضر براي نخستين مرتبه تنوع مولكولي جدايه هاي PAV در نوار شمالي ايران مورد بررسي قرار گرفت . براي اين منظور، با توجه به تفاوت قابل ملاحظه در ساختار ژني ويروس هاي خانواده لوتيوويريده كه نيمه 3 ژنوم آنها شامل چهارچوب هاي ژني سه ، چهار و پنج ، در كل خانواده حفاظت شده است اما نيمه ديگر كه شامل ژن هاي پليمراز مي گردد تنها در هر جنس حفاظت شده اند، قسمتهايي از دو چهارچوب ژني يك و پنج كه متعلق به دو نيمه مجزاي ژنوم هستند براي تكثير و مطالعه تنوع ژنتيكي در نظر گرفته شد. براي رديابي اين ويروس در نمونه هاي گندم و جو جمع آوري شده از استان هاي خراسان رضوي ، خراسان شمالي ، گلستان ، مازندران ، زنجان ، آذربايجان شرقي ، آذربايجان غربي و كردستان از آزمون هاي )ELISA( enzyme- linked immunosorbent assay و tissue print immuno assay )TPIA( استفاده گرديد. جهت بررسي هاي مولكولي با استفاده از روش RT-PCR ، پس از استخراج ار.ان .اي كل با استفاده از كيت RNX )-Plus( به توان TM ، قطعه اي از ژن پليمراز )ORF1( به طول bp 903 و قسمتي از ژن پيوسته خواني )ORF5( به طول bp 575 با دو جفت آغازگر اختصاصي تكثير گرديد. قطعه هاي حاصل از PCR با استفاده از Cloning Kit )Fermentsa( InsT/A Clone PCR Product در پلاسميد PTZ75R/T وارد و باكتري E. coli نژاد DH5 آلفا همسانه سازي شد. آناليز ترادف اسيدهاي آمينه قسمت تكثير شده ناحيه ORF5 حاكي از شباهت بالاي جدايه هاي ايراني با جدايه هاي موجود در بانك ژن بود...