دراسة جزيئية و كيموحيوية لبعض سموم البكتريا Helicobacter pylori المعزولة من مرضى عراقيين

درست تواليات البروتينات protein sequence لسموم جين CagA (المنطقة الطرفية 3 ) وسم VacA بمختلف مناطقه (s,i,m) المعزولة من بكتريا Helicobacter pylori لمصابين عراقين بامراض مرتبطة بهذه الجرثومة باستخدام برامج مختلفة. و اوضحت النتائج اختلاف في نوعية الحوامض الامينية عن المسجل في السلالات من مناطق اخرى من العالم مثل الصين و اليابان. وامتازت تواليات السم CagA بنوع من الثبوت مقارنة بمناطق VacA التي اختلفت بشكل كبير في السلالات المختلفة . واظهرت البروتينات صفة كراهية الماء بشكل عام . توزعت الحوامض الامينية على التراكيب الثانوية مثل صفائح بيتا وحلزونات الفا واللفات عشوائية الشكل ، اذ احتوت بعضها على التراكيب الثلاث ، في حين كانت جزيئات VacA / المنطقتين الوسطى والبينية (m,i) خالية من الحلزونات ، اما منطقة الاشارة (s) من السم فامتازت بوجود الحلزونات في s2 والقليل من الصفائح في s1 . درست فعالية السم CagA المعتمدة على الفسفرة وتبين ان البيئة التي يوفرها التوالي EPIYA ضرورية لفسفرة التايروسين اذ لم يكن بالامكان فسفرته خارج هذا التوالي باستعمال برامج التنبو بحدوث عملية الفسفرة. كانت كل التواليات المدروسة مثيرة للمناعة واغلبها عد من عوامل الضراوة . تم حدس تداخلات الجزيئات مع مكونات الخلية الاخرى باستعمال التواليات كاساس للبحث في قاعدة البيانات STRING اظهرت النتائج تداخلات كبيرة وتختلف نوعا ما على الاختلاف في التواليات .