مطالعه تاثير اندازه ي متفاوت جمعيت مرجع و رابطه ي خويشاوندي بر صحت ايمپيوتيشن ژنوتيپ در گاوميش هاي ايتاليايي

در این مطالعه تاثیر اندازه ی متفاوت جمعیت مرجع و رابطه ی خویشاوندی جمعیت آزمون با گروه مرجع با استفاده از روش ایمپیوتیشن FImpute با استفاده از اطلاعات ۹۲۰ راس گاومیش مدیترانه ای ایتالیایی كه با تراشه های Axiom Buffalo 90k SNP-Chip تعیین ژنوتایپ شده بودند مورد بررسی قرار گرفت. نشانگرهایی كه دارای فراوانی آلل نادر بالایی بودند به عنوان كاندیدا برای چیپ كم تراكم 10k انتخاب شدند. تعداد ۴۲، ۷۷، ۲۰۲، ۴۱۲ و ۷۳۲ فرد به عنوان افراد گروه مرجع و حیوانات ۴ نسل اخیر شامل ۱۸۳ فرد به عنوان جمعیت آزمون انتخاب شدند. ماتریس رابطه ی خویشاوندی آللی برای جمعیت تشكیل شد و رابطه ی خویشاوندی افراد جمعیت آزمون با جمعیت مرجع محاسبه شد. نتایج نشان داد كه افزایش اندازه ی جمعیت مرجع باعث افزایش صحت ایمپیوتیشن می شود. رابطه ی خویشاوندی افراد جمعیت آزمون با جمعیت مرجع صحت ایمپیوتیشن را مخصوصا هنگامی كه اندازه ی جمعیت مرجع كم بود بیشتر تحت تاثیر قرار داد.