شناسايي بيوانفورماتيكي و بررسي تغيير بيان microRNA هاي كانديد پاسخ به تنش خشكي در برنج

(miRNA)MicroRNA ها نقش مهمی را در تنظیم بیان ژن‌ها در سطح پس از رونوشت‌برداری در گیاهان بازی می‌كنند. مطالعات اخیر نشان داده‌‌‌اند كه miRNA ها، در بسیاری از فرایندهای مرتبط با تكثیر، رشد و نمود و پاسخ گیاه به تنش‌های زنده و غیرزنده نقش دارند. در این تحقیق ژن‌های هدف miRNA های برنج با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیكی شناسایی و miRNA هایی كه در كنترل ژن‌های دخیل در پاسخ به تنش خشكی نقش داشتند، مشخص شدند. سپس تغییر بیان برخی از این miRAN ها با استفاده از روش Qrt-PCR و آغازگرهای Stem-loop در شرایط تنش خشكی در مقایسه با شرایط عادی مورد بررسی قرار گرفت. miR444,mi3979,miR529 كه به ترتیب در كنترل ژن‌های دخیل در انتقال پیام اكسین، فاكتورهای رونویسی SPL و فاكتورهای رونویسی MADS نقش دارند، كاهش بیان معنی‌داری را نشان دادند. كاهش بیان miR529,miR3979 می‌‌تواند متعاقباً باعث افزایش بیان ژن‌های فسفوریبوزیل ترانسفراز، BIG,BTBZI درگیر در مسیرهای پیام‌رسانی اكسین گردد. هم‌چنین كاهش بیان miR444,miR529 نیز می‌تواند به تغییر بیان برخی فاكتورهای رنویسی MADS,SPL كه در بسیاری از فرایندهای اساسی گیاه مانند نمو نقش دارند، منجر گردد. بنابراین این miRNAها در برنج با كنترل مسیرهای پیام‌رسانی هورمون اكسین و تنظیم فاكتورهای رونویسی كه خود مسئول تنظیم بسیاری از ژن‌های پاسخ به تنش هستند ، در شرایط تنش نقش خود را ایفا می‌كنند