طراحي آپتامر جهت شناسايي تركيب نيترو آروماتيك TNT و بررسي كارايي آن

Design of aptamer for detection of TNT as a nitroaromatic compound and review its performance

هدف- تركيبات نيتروآروماتيك، علاوه براينكه از نظر امنيتي، حائز اهميت است، از نظر زيست محيطي نيز داراي اهميت است. از گذشته تا كنون روشهاي آناليزي و كلاسيكي متعددي جهت شناسايي تركيبات نيتروآروماتيك بكار گرفته شده است. نظير روشهاي كلريمتريك، HPLC و GC-MS ، كه اغلب حاوي روش هاي حسگري و شناسايي متفاوت مي‌باشند. جهت شناسايي مواد نيتروآروماتيك، اندازه‌گيري TNT در مقادير كم آن، بسيار ضروري است. براين اساس، در راستاي طراحي روشهاي ساده و كم هزينه جهت شناسايي تركيبات آروماتيك، تحقيقات متعددي تاكنون صورت گرفته است. در اين كار تحقيقاتي، با طراحي آپتامر شناساگر TNT، تلاش شده است، روش نويني جهت شناسايي آن ارائه گردد. روش- با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي و ترادف هاي تصادفي (دو ترادف20 بازي مشخص جهت اتصال پرايمرها و 80 باز تصادفي در وسط)، PCR انجام گرفت. در مرحله بعد غربالگري و شناسايي بهترين ترادف به كمك روش ELONA (Enzyme Linked Oligonucleotide Assay) و با استفاده از TNT متصل شده به پروتئين آلبومين (TNP-BSA) صورت گرفت. در نهايت نيز حساسيت روش مورد آناليز و مطالعه قرار گرفت. نتيجه تحقيق- نتايج حاصله نشان داد كه آپتامر بدست آمده داراي كارايي و حساسيت مناسب در شناسايي TNT بوده و مي تواند به عنوان آپتاسنسور شناساگر TNT در مطالعات آتي استفاده گردد.

Purpose - In addition of security concerns, from the environment, nitroaromatic compounds is also important. Since the past several analysis and classical methods has been used to identify nitroaromatic compounds. Such as by colorimetric methods, HPLC and GC-MS, that often contains different sensing and detection methods. TNT measured at low levels, is essential for identify nitroaromatic compounds. Accordingly, in order to design simple and inexpensive methods for detection of aromatic compounds, numerous studies have been done so far. In this research, with design of aptamer for detection of TNT, is an effort, a new method for its identification should be presented. Method - PCR was performed by using special primers and random sequences (two determined sequences of 20 bases for connecting primers and 80 random bases in the middle). Then Screening and identify the best sequence was performed with ELONA technique (Enzyme Linked Oligonucleotide Assay) and using the TNT attached to the albumin protein (TNP-BSA). Result - The results showed that the obtained aptamer has efficiency and good sensitivity for detection of TNT and can be used as an TNT detector aptasensor in future studies