برهمكنش تاكا آميلاز وحشي و انواع كوتاه شده با مايع يوني 1- بوتيل-3- متيل ايميدازوليوم كلريد: مطالعه داكينگ

هدف از انجام اين پژوهش بررسي قابليت اتصال 1-بوتيل-3-متيل ايميدازوليوم كلريد با سه نوع آنزيم مختلف است. با استفاده از روش مهندسي آنزيم در اين سيليكو، به ترتيب 50 (آميل-S1) و 100 (آميل-S2) اسيدهاي آمينه از آميل- C براي توليد اشكال ناقص حذف شدند. برهمكنش ساختار وحشي (آميل-c) و كوتاه شده تاكا آميلاز با مايع يوني 1-بوتيل-3- متيل ايميدازوليوم كلريد توسط روش داكينگ بررسي شد. اسيدهاي آمينه هيدروفيل در جايگاه اتصال آنزيم- ليگاند نقش مؤثري دارند به همين خاطر با استفاده از نرم افزار تحت وب Protscale از طريق بانك اطلاعات اكسپسي توالي آميل-C از لحاظ هيدروفوبيسيته و هيدروفيليسيته بررسي گرديد سپس براي اين منظور نتايج هر سه آنزيم توسط نرم افزارligplot+ تعيين و با مقايسه امتياز هيدروپاتي آمينواسيدهاي حاضر در جايگاه اتصال ليگاند با آنزيم ها اين نتيجه استنباط شد كه برهمكنش آميل-C نسبت به آميل-S1 وآميل-S2 آمينواسيدهاي هيدروفيل بيشتري دارد اگر چه كه افينيتي آميل–S1 نسبت به آميل-C وآميل-S2 بيشتر است.