مقايسه سه روش جداسازي DNA ژنومي از بافت برگ، ساقه و ريشه مركبات

Comparison of Three DNA Extraction methods from Leaves, Shoots and hairy Roots of Citrus species

پيشرفت هاي اخير در زمينه بيوتكنولوژي و اصلاح درختان ميوه تمركز پژوهش ها را به سمت تكنيك هاي سلولي و ملكولي سوق داده است. در اين ميان مركبات به عنوان يكي از محصولات باغي مهم كشور از اهميت خاصي برخوردار است. به عنوان گام اول در چنين پژوهش هايي، استقرار يك روش مناسب و كارآمد جهت استخراج DNA ژنومي خالص و با غلظت مطلوب از اهميت زيادي برخوردار است. در مقاله پيش رو، راندمان سه روش استخراج DNA مبتني بر روش CTAB جهت استخراج DNA ژنومي از بافتهاي مختلف درختان مركبات شامل برگ، ساقه و ريشه از نقطه نظر غلظت و خلوص DNA به دست آمده و نيز كارايي روش مقايسه شد. تفاوت عمده اين روش ها در مدت زمان مرحله هضم سلولي و نحوه اجراي آن، مراحل آلودگي زدايي پروتئيني و نيز مرحله رسوب دهي DNA است. از ميان سه روش مورد بررسي روش عليزاده و همكاران اگرچه به لحاظ زماني طولاني تر بود اما DNA حاصل از آن عاري از آلودگي هاي RNA، پروتئيني، پلي ساكاريدي بود. اين روش در مقايسه با دو روش ديگر، كارايي بهتري را در استخراج DNA از بافتهاي مختلف به ويژه ريشه هاي مويي نشان داد. روش معصومي و همكاران نيز به دليل مقرون به صرفه بودن از نظر زمان و نيز سهولت اجرا در مورد پژوهش هايي كه تعداد نمونه ها زياد و غلظت اندك DNA مساله ساز نمي باشد قابل استفاده و سودمند است.