ارائه يك چارچوب جديد مبتني بر آنتولوژي ژن در روش خوشه بندي همپوشان براي داده هاي بيان ژني

يكي از محدوديت‌هاي روش‌هاي سنتي براي خوشه‌بندي داده‌هاي بيان ژن، يافتن خوشه‌هاي مجزا است كه هدف نهايي اغلب اين الگوريتم‌ها مي‌باشد. در حاليكه خوشه هاي همپوشان با دقت بالا در درك تعاملات صحيح مابين ژن ها و يافتن شبكه هاي ژني قابل اطمينان نقش مهم و بسزايي دارند، در اين مقاله الگوريتم OverDBC، كه يك روش خوشه‌بندي مبتني‌ بر چگالي جديد براي مدلسازي خوشه‌هاي همپوشان است، با مفهوم آنتولوژي ژن توسعه داده مي شود. اين الگوريتم ليست‌هايي از ژن‌هاي مشابه را با درنظرگرفتن سطوح بيان آنها ايجاد مي‌كند كه اين امر ممكن است لزوما دانش قبلي را منعكس نكند. بنابراين نياز به تمركز بر روي روش‌هايي است كه اطلاعات تشابه بدست آمده از آنتولوژي ژن را براي پشتيباني تحليل بيان ژن مبتني ‌برخوشه‌بندي، تجميع كند. با تركيب دانش آنتولوژي ژن و داده‌هاي همبستگي بيان ژن براي اين روش خوشه‌بندي، مي توان ناسازگاري‌ها را به حداقل ‌رساند و نزديك‌ترين نقاط را در يك خوشه قرار داد. نتايج ارزيابي خوشه ها و همچنين شبكه هاي ژني استخراج شده نشان مي دهد كه تركيب اطلاعات آنتولوژي ژن با پارامتر فاصله ساختاري، منجر به بهبود نتايج خوشه‌هاي همپوشان مي‌شود.