ارزيابي مسيرهاي بيولوژيكي پاسخ ايمني مرغ‎ها به ويروس H5N1 با استفاده از نرم‎افزار Path Visio

مرغ و اردك ميزبان‎هاي اصلي ويروس H5N1 هستند. معمولاً ويروس آنفلوانزا در مرغ‎ها سبب بروز علائم ظاهري و بيماري زودگذر مي‎شود. هدف مطالعه حاضر استفاده از داده‎هاي ريزآرايه براي بررسي مسيرهاي بيولوژيكي فعال در عفونت H5N1 مرغ‎هاست. براي انجام اين بررسي داده‎هاي ريزآرايه از بانك اطلاعاتي ArrayExpress (ebi.ac.uk/arrayexpress; Accession No: E-GEOD-53931) استخراج شد. داده‎هاي فوق مربوط به يك مطالعه روي بيان كلي ژن‎هاي شش مرغ‎هاي آلوده به ويروس H5N1 سويه CK10 بود. كيفيت داده‎ها توسط امكان موجود در وب سايت ArrayAnalysis.org انجام گرفت. سپس با استفاده از نرم‎افزار Path Visio ورژن 3.2.2 مسيرهاي بيولوژيكي رسم شد. تعداد ژن‎هايي كه در مسيرهاي بيولوژيكي مداخله داشتند و شامل معيارهاي كنترل كيفيت بودند 172 بود. دو مسير بيولوژيكي با معيار Z معني‎دار شناسايي شدند. EPO Receptor Signaling 1,2 و EGFR1 Signaling Pathway در پاسخ به H5N1 فعال بودند. ژن‎هاي زيادي در اين دو مسير افزايش يا كاهش بيان داشتند كه لازم است از لحاظ نوع عملكرد و ساختار بررسي شوند.