بررسي ويژگي سوبسترايي آنزيم آلژينات لياز بدست آمده از Pseudomonas aeruginosa s21در مقايسه با توالي هاي آمينواسيدي و ژني سويه هاي مختلف اين باكتري

آلژينات پلي ساكاريدي خطي از بتا-دي-مانورونات (M) و/ يا آلفا-اِل-گولورونات (G) با پيوند كووالانسي 1-4 است و از جمله مواد اصلي تشكيل دهنده بيوفيلم باكتري P. aeruginosa و يكي از علل مقاومت آنتي بيوتيكي آن مي باشد. آلژينات ليازهاي مختلف، سوبستراهاي اختصاصي متفاوتي شامل آلژينات حاوي بلوك G، بلوك M و بلوك MG را شناخته و تخريب مي كنند .پيدا كردن ترادف هاي نوكلئوتيدي در ژن algL مربوط به باكتري P. aeruginosa مي باشد كه با ويژگي سوبسترايي اين آنزيم در ارتباط هستند.ارزيابي فعاليت آنزيم بر بلوك هاي G، M و MG با روش TBA انجام گرفت. هم چنين پايگاههاي اطلاعاتي NCBI و Uniprot و سرور Clustalw براي پيدا كردن ترادف هاي نوكلئوتيدي و آمينواسيدي مربوط به ويژگي سوبسترايي آلژينات ليازها استفاده شدند.آنزيم آلژينات لياز باكتري P. aeruginosa s21ترجيحا بر بلوك MG موثر است. آمينواسيدهاي كاملاً حفاظت شده اي در همه ژن هاي algL مربوط به سويه هاي P. aeruginosa وجود دارد. هم چنين، همترازي هاي بين ژن هاي algL مربوط به آلژينات ليازهاي با ويژگي سوبسترايي متفاوت، اختلافاتي را در توالي هاي مربوطه نشان دادند. ترادف هاي آمينواسيدي و اسيد نوكلئيكي مرتبط با ويژگي سوبسترايي متفاوت آلژينات لياز ها مشخص گرديد. بنابراين مي توان به وسيله تغييرات در اين نواحي آنزيم هايي با ويژگي سوبسترايي دلخواه ايجاد كرد و به اين ترتيب آلژينات هاي مختلف را در انواع بيوفيلم هاي باكتري هاي P. aeruginosa تخريب كرد و حساسيت آنتي بيوتيكي آن را افزايش داد.