مقايسه چندشكلي هاي جايگاه ژني SLC37A2 موثر بر صفات توليد مثلي در گاو هلشتاين و مونبليارد

Comparing polymorphism in SLC37A2 locus affecting reproduction traits in Holstein and Montbeliarde cattle

ژن SLC37A2 در ناحيه هاپلوتايپ MH2 گاو مونبليارد قرار داشته و به طور موثري باعث كاهش باروري در گاو مي شود. هدف از پژوهش حاضر شناسايي واريانت هاي آللي ژن SLC37A2 با روش PCR-SSCP در گاوهاي هلشتاين و مونبليارد در ايران بوده است. به اين منظور 250 نمونه خون (150 نمونه هلشتاين و 100 نمونه مونبليارد) تهيه و استخراج DNA با كيت انجام شد. سپس يك قطعه از اگزون 2 اين ژن كه حاوي جهش موثر بر باروري گاوهاي هلشتاين و مونبليارد بود با طراحي يك جفت آغازگر اختصاصي با نرم افزار Oligo7 تكثير شد. پس از PCR تعيين زنوتيپ نمونه ها با روش SSCP انجام و فراواني هاي ژني و زنوتيپي با نرم افزار POPGEN محاسبه شدند. در اين جايگاه دو ژنوتيپ AA و AB به ترتيب با فراواني هاي 98/0، 02/0 و 86/0 و 14/0 درصد در دو نژاد هلشتاين و مونبليارد مشاهده شدند. همچنين فراواني هاي آللي در دو جعيت هلشتاين و مونبليارد براي آلل هاي A و B به ترتيب 99/0، 01/0 و 93/0 و 07/0 برآورد گرديد. تست دقيق فيشر و تست كاي-اسكوئر به ترتيب براي مقايسه فراواني هاي آللي و ژنوتيپي بين دو جمعيت نشان داد كه اختلاف آماري معني داري از نظر فراواني آللي وجود ندارد اما فراواني هاي ژنوتيپي با هم اختلاف معني دار آماري (P 0.05) نشان دادند. با توجه به نقش اين ژن در توليد مثل گاو هلشتاين و مونبليارد با توجه به نتايج حاصل شده در اين پژوهش بررسي ساير قسمت هاي ژن SLC37A2 از جمله ناحيه تنظيمي آن و ارتباط آن با صفات توليدمثلي و توليدي در جمعيت گاوهاي شيري پيشنهاد مي شود.

The SLC37A2 is located in MH2 haplotype of Montbeliarde cattle and effectively causes to reduction of fertility in cattle. The aim of present study was to detection of allelic variants of SLC37A2 gene in Holstein and Montbeliarde cattle by PCR-SSCP method. For this purpose, 250 blood samples (150 Holstein samples and 100 Montbeliarde samples) were prepared and DNA was extracted by kit. Then, a fragment from exon 3 of this gene which contain mutation affecting fertility in Holstein and Montbeliarde cattle was amplified with specific primer paires designed by Oligo7 software. After PCR, the genotyping was done by SSCP assay and allelic and genotypic frequencies were calculated by POPGEN software. In this locus two genotypes of AA and AB were observed in Holstein and Montbeliarde cattle with frequencies of 0.98, 0.02 and 0.86 and 0.14, respectively. Also, allelic frequencies for A and B alleles were 0.99, 0.01 and 0.93 and 0.07 in Holstein and Montbeliarde, respectively. The Fisher exact test and Chi-square test for comparing allelic and genotype frequencies between two populations showed no significant difference in allelic frequencies but genotype frequencies showed significant differences (P 0.05) between two populations. According to role of this gene in reduction of fertility in Holstein cattle and according to results obtained from present study, investigation of other regions of SLC37A2 such as regulatory region and introns and its association with reproduction and production traits in population of dairy cattle are recommended.