پيش بيني ساختار سوم پروتئين بر اساس مدل پنهان ماركوف

پيش بيني ساختار سوم پروتئين باعث مي شود كه عملكرد پروتئين در بدن انسان شناسايي گردد و در تشخيص بيماري ها و طراحي دارو نقش مهمي ايفا مي كند. در مقايسه با تعداد بسيار زياد توالي پروتئين شناخته شده، ساختار تعداد كمي از پروتئين ها مشخص شده است. با رشد بيشتر شكاف بين توالي ها و ساختمان هاي شناخته شده، نياز به توسعه روشدهاي پيشگويي كه قابل اعتماد باشند افزايش يافته‌است. الگوريتم پيشنهادي با استفاده از داده‌هاي دنباله پروتئين‌ها و مختصات جغرافيايي اتم كربن اصلي در ستون فقرات آمينو اسيدها مدلي بر مبناي شبكه براوه مكعبي با استفاده از مدل پنهان ماركوف ايجاد شده است. مدل پنهان ماركوف توانسته است دقت بيشتري به صورت كلي نسبت به ساير روش ها كسب كند. مختصات سه بعدي اتم هاي كربن اصلي كمك شاياني به بهبود دقت روش پيشنهادي كرده است و توانسته مسير حركت توالي هاي آمينو اسيد هاي پروتئين هاي داده هاي آموزشي در مختصات سه بعدي را به خوبي يادگيري كند و داده اي آزمايشي را به هر فولد مرتبط انتساب دهد.