آناليز ساختار ژنتيكي جمعيت گوسفندان بومي ايران با استفاده از نشانگرهاي متراكم چندشكلي تك نوكلئوتيدي

اين تحقيق با هدف بررسي ساختار ژنتيكي گوسفندان بومي براساس استفاده از نشانگرهاي چندشكلي تك نوكلئوتيدي انجام شد. بدين منظور تعداد 99 راس گوسفند از نژادهاي افشاري( 34 )، مغاني( 24 ) و قزل( 35 ) استفاده شد. نمونه ها با استفاده از آرايه هاي Illumina OvineSNP50K Beadchip تعيين ژنوتيپ شدند. پس از حذف جايگاه هاي داراي عدم تعادل پيوستگي، 18346 جايگاه SNP جهت آناليزهاي بررسي ساختار ژنتيكي باقي ماند . آناليز مؤلفه هاي اصلي و روش آماري بيزي جهت بررسي ساختار ژنتيكي گوسفندان بومي كشور در اين مجموعه داده به كار گرفته شد. نتايج حاصل از اين تحقيق نشان داد كه در اولين سطح خوشه بندي ((k=2 جمعيت هاي مغاني(1/ 83 درصد) و قزل (5/ 96 درصد) نيز خوشه مشتركي قرار گرفتند و نژاد افشاري خوشه متمايز ديگري را به خود اختصاص داده است. وجود سه خوشه K=3 در دادهها موجب قرار گرفتن نژاد قزل در يك خوشه مستقل شد. در اين مطالعه تفاوت هاي ژنتيكي گوسفندان بومي ايران به خوبي به وسيله داده هاي متراكم SNP شناسايي شدند كه اين امر مي تواند كمك كند كه دستيابي به بهبود ژنتيكي از طريق مطالعات همبستگي ژنوم و انتخاب ژنومي سرعت بخشد.