آناليز بيوانفورماتيكي پروموتور ژن بتا آميرين سنتاز كاسني در گياهان مدل آرابيدوپسيس و برنج

تري ترپن ساپونين¬ها يكي از مهم¬ترين متابوليت‌¬هاي ثانويه‌ در گياه كاسني هستند كه در صنعت و پزشكي از اهميت ويژه¬اي برخوردارند. در بين تري ترپن ساپونين¬ها معمول¬ترين نوع، بتا آميرين مي¬باشد كه توسط آنزيم بتا آميرين سنتاز با پيش ماده اكسيد¬و¬اسكوالن ايجاد مي¬شود. در رابطه با ژن سنتز كننده اين آنزيم و توالي پروموتوري آن در گياه كاسني، اطلاعات كافي در بانك¬هاي ژني وجود ندارد. از اين¬رو در اين مطالعه به بررسي ناحيه پروموتوري ژن بتا آميرين سنتاز به عنوان يك ژن كليدي در مسير بيوسنتز ساپونين¬ها در گياهان مدل آرابيدوپسيس و برنج پرداخته شد. به اين منظور توالي پروموتوري ژن بتا آميرين سنتاز آرابيدوپسيس و برنج از بانك اطلاعاتي NCBI دريافت شد. بررسي پروموتور¬ها با استفاده از سايت Plant CARE انجام، موتيف¬ها و نواحي Cis- regulatory elementsموجود در هر پروموتور و نقش آن¬ها مشخص گرديد. نتايج نشان داد پروموتور اين ژن در هر دو گياه، جز پروموتور¬هاي القا¬پذير (Inducible promoters)بوده و متاثر از استرس¬هاي زيستي و غير زيستي مي¬تواند باعث تغيير در بيان ژن مربوطه¬گردد.