مطالعه برهمكنش مشتقات كوئينو كسالين با فسفودي استراز 2 با استفاده از روش داكينگ مولكولي

آنزيم هاي PDE، هيدرولازهايي هستند كه به طور انتخابي هيدروليز نوكلئوتيدهاي cAMP و cGMP را كاتاليز مي كنند وتاكنون 53 ايزوآنزيم ازآن ها شناسايي شده است، اين آنزيم ها دسترسي پيام رسانه هاي ثانويه به عامل هاي درون سلولي شان را كنترل مي كنند. فسفودي استراز با عمل هيدروليز كاتاليتيكي مي تواندcAMP /cGMP را غيرفعال كند كه اين مكانيسم باعث بروز بسياري از اختلالات عصبي و رواني مانند اسكيزوفرني است . به همين دليل مهاركننده PDE2Aبه عنوان رويكرد درماني دربيماريهايي مثل اسكيزوفرني وآلزايمر در نظر گرفته شده است. اخيرأ وگنر و همكارانش دسته‌اي از مهاركننده‌هاي فسفودي استراز 2(PDE2A) را سنتز نموده اند و ليستي ازاين مهاركننده ها همراه با مقدار IC50 آنها ارايه داده اندكه داده هاي ما در اين پروژه است. به كمك نرم‌افزار HyperChem ابتدا شكل سه بعدي مولكول‌ها رسم مي‌شود. سپس ساختار مولكول را مي‌توان به روش‌هاي مختلف بهينه كرد. هدف از انجام اين پروژه پيش بيني فعاليت مهاركنندگي مشتقات كوئينوكسالين بر روي PDE2A جهت پيش‌بيني فعاليت و همچنين شناسايي عوامل ساختاري موثر براي طراحي يك دارو با فعاليت بيشتر در درمان اسكيزوفرني است. رسم وبهينه سازي تركيبات با Hyperchem انجام شد ، داكينگ مولكولي توسط نرم افزار Autodock 4.2 و Autodock vina و Arguslab انجام شد ونتايج با Ligplot بررسي شد. با بررسي تعامل بين پيوندهاي هيدروژني وواندروالسي وبرهمكنش هاي هيدروفوب به پيش بيني فعاليت زيستي يك تركيب فعال يا غيرفعال دست مي يابيم. دراين تحقيق همه ي 21 ليگاند دردسته ي تركيبات فعال قرار گرفت. بررسي نتايج داكينگ اطلاعات مفيدي را درمورد برهمكنش هاي اين مهاركننده ها با آنزيم دراختيار ما قرار داد.وجود پيوندهاي هيدروژني وطول اين پيوندها در پيش بيني فعاليت اين ليگاندها توسط داكينگ مولكولي ارتباط معناداري را نشان داد.