آناليز Target scan در توالي¬هاي ژن هاي TLR انسان با برنامه پايتون و تاييد آن بر اساس مدل بيماري كرون

گيرنده¬هاي تشخيص الگو (PRRs) از مهمترين اجزا سيستم¬ايمني ذاتي انسان به¬شمار مي آيند كه فعال¬شدن آن¬ها پس از تماس با آنتي¬ژن باكتريايي و ويروسي، شروع يك سلسله فرايند¬هاي متوالي در پاسخ¬هاي فوري و اكتسابي به آن را در پي¬خواهد داشت. هرگونه اختلال در تنظيم ميزان فعال¬شدن اين سيستم موجب ابتلا به بيماري¬هاي خودايمني (مانند كرون) و متعاقبا سرطان و از طرف ديگرابتلا به عفونت¬هاي مزمن مي گردد. از مهمترين سيستم¬هاي تنظيم ميزان بيان و رونويسي ژن¬ها ميكروRNA ها (miRNA) كه تا به امروز تعداد 22848 از miRNA ها با تاييدات آزمايشگاهي به عنوان تنظيم¬كننده¬هاي گيرنده¬هاي شبه¬تول (TLRs) به¬عنوان مهمترين اعضاي PRRs معرفي گرديده است. با توجه به اهميت TLRs در تعادل سيستم ايمني در تحقيق حاضر با استفاده از آناليز Target scan بر مبناي برنامه تنظيم شده در محيط برنامه¬نويسي پايتون انواع حالات اتصال miRNA و تارگت براي هر 10 عضو TLRs به كار گرفته شد. miRNA هاي كانديد بر اساس ساير پارامترهاي اتصال با ژن هدف غربالگري گرديد. جهت تاييد نتايج بدست آمده از مدل بيماري كرون در نمونه¬هاي ترانسكريپتوم ميكرواري موجود در ديتابيس array express به شماره ثبتE-MTAB-4371 استفاده گرديد. نتايج بدست آمده از اين آناليز نشان داد كه ميزان بيان ميكروRNA هايي بدست آمده د ربرنامه جستجوي هدف طراحي شده با پايتون به طور معني داري در نمونه هاي بيماري كرون نسبتبه گروه كنترل بيان كمتري داشته اند. نتايج حاصل در مجموع نشان داد كه متدولوژي بكار گرفته¬شده در تحقيق حاضر قابليت تشخيص ميكروRNAهاي جديد براي TLRs ها را دارا بوده و مي توانند در مطالعات آنتولوژي ژن بكار گرفته شود.