شماره ركورد كنفرانس :
4376
عنوان مقاله :
اعتبار سنجي پايدار استخراج امضاهاي بيان ژن
پديدآورندگان :
توكل الهه
دانشگاه شيراز، هيئت علمي بخش اصلاح نباتات , همايوني هنگامه Hengameh_homayouni@yahoo.com
دانشجوي دكتري اصلاح نباتات ، دانشگاه شيراز؛
كليدواژه :
امضاي بيان ژن , خوشه بندي , پايداري , بيو انفورماتيك
عنوان كنفرانس :
اولين كنفرانس بين المللي يافته هاي نوين در بيوتكنولوژي
چكيده فارسي :
شناسايي ژن هاي كانديد معتبر فنوتيپ خاص، مانند سرطان، يكي از چالش هاي عمده در زمينه بيوانفورماتيك بوده است. با توجه به مجموعه داده ريزآرايه DNA ، روش هاي سنتي انتخاب ويژگي هاي ليستي از ژن ها كه به طور قابل توجهي تحت تغييرات داده هاي آموزشي متفاوت بسيار متغير هستند را توليد مي كند. كه بي ثباتي مانع از اعتبار يافته هاي تحقيقاتي مي شود و ترديدهايي را در مورد قابليت اطمينان چنين روش هايي ايجاد مي كند. در اين مطالعه، ما يك چارچوب براي استخراج امضاي ژنومي پايدار ارائه مي كنيم. روش پيشنهادي ثبات در مرحله اعتبار سنجي، مستقل از انتخاب ويژگي و روش هاي طبقه بندي استفاده شده را به اجرا مي گذارد. معناي آماري مجموعه ژن انتخاب شده است نيز مورد بررسي قرار مي گيرد. نتايج حاصل از اين مطالعه اهميت مسائل مربوط به ثبات در امضاي ژنومي را، فراتر از قابليت هاي پيش بيني خود نشان مي دهد. براي اينكار ما از يك مجموعه نرم افزاري كه براي پياده سازي و ساخت برخي از روش هاي پيش بيني و يك روش محاسباتي بر اساس نمايه سازي معنايي نهفته (LSI) توسعه يافته كمك مي گير يم كه هم استنباط و هم تفسير در دسترس براي جستجوي شباهت ژن ها از لحاظ معنايي را ممكن مي سازد.