مقايسه مشخصات دو ژن پروتئين غشايي در فيتوپلاسماهاي متعلق به گروه 16SrII

فيتوپلاســماها شــامل پروكاريوتهــاي بيماريــزاي گياهــي هســتند. در ايــن مطالعــه دو ژن مربــوط بــه پروتئينهــاي غشــايي در چنــد فيتوپلاســماي متعلــق بــه گــروه 16srII شــامل فيتوپلاســماهاي جــاروك ليموتــرش، جــاروك يونجــه جدايــه هــاي فــارس و سيســتان و فيلــودي خيار بررســي شــد. بــا طراحــي آغازگــر ،ژنهــاي مربــوط بــه پروتئيــن اصلــي غشــاء (Imp) و پروتئيــن غشــايي ديگــر (IntImp)در هــر 4 فيتوپلاســما تكثيــر و تــرادف آنهــا تعييــن شــد. آناليزهــاي انجــام شــده نشــان داد كــه Imp داراي يــك ناحيــه تراغشــايي بــه انــدازه 20 آمينــو اســيد اســت. 20 آمينواســيد اول ايــن پروتئيــن در داخــل سيتوپلاســم و ناحيــه اصلــي پروتئيــن در ســمت انتهــاي C (130 آمينــو اســيد) در خــارج ســلول پيــش بينــي شــد. ميــزان شــباهت نوكلئوتيــدي زن Imp بيــن ايــن 4 فيتوپلاســما 79 تــا 99 درصــد (فيتوپلاســماهاي فيلــودي خيــار و يونجــه سيســتان) بــود. ميــزان فشــار انتخــاب( dN/dS) روي ايــن ژن 8/. بــود ( فشــار انتخــاب منفــي). تعــدادي از آمينــو اســيدها نيــز تحــت فشــار انتخــاب مثبــت شناســايي شــدند. آناليزهــاي مشــابه روي ژن IntImp نشــان داد كــه پروتئيــن محصــول ايــن ژن داراي 6 ناحيــه تراغشــايي اســت. ســمت انتهــاي N پروتئيــن IntImp در داخــل سيتوپلاســم و انتهــاي C در خــارج سيتوپلاســم بــود. ميــزان تنــوع نوكلئوتيــدي در ژن مذكــور ذر بيــن فيتوپلاســماهاي مــورد مطالعــه 85 تــا 100 درصــد بــود. ميــزان فشــار انتخــاب روي ايــن ژن 0.5 بــود و هيــچ آمينــو اســيدي تحــت فشــار انتخــاب مثبــت روي آن شناســايي نشــد.با توجــه بــه نتايــج مشــخص شــد كــه رونــد تغييــرات روي ژنهــاي غشــايي فيتوپلاســماهاي گــروه 16SrII مشــابه نبــوده و ژن Imp داراي تنــوع بيشــتري بــوده و بــراي تفكيــك فيتوپلاســماهاي نزديــك مناســب تــر اســت. همچنيــن وجــود آمينواســيداهيي تحــت فشــار انتخــاب مثبــت روي ايــن ژن نشــان از اهميــت بيولوژيكــي آن در برهمكنــش يــا پروتئينهــاي ديگــر دارد.