بررسي گروه هاي فيلوژني گونه هاي اشرشيا كلي جدا شده از سواحل خليج فارس در بوشهر بر اساس روش جديد فيلوتايپينگ كلرمونت

در ســال 2013 كلرمونــت، بــر اســاس روش جديــد واكنــش زنجيــره اي پليمــراز چهارگانــه1 گونــه هــاي اشرشــيا كلــي را بــه هشــت گــروه A(وBو CوDوEوFوCladeوUnknown( فيلوژنــي طبقــه بنــدي كرد.بــر اســاس ايــن طبقــه بنــدي گروههــاي بيماريــزا عمدتــا متعلــق بــه گروههــاي B2( و)D و بيشــترين گونــه هــاي مدفوعــي متعلــق بــه گروههــاي A(و)B1 هســتند. هــدف از ايــن مطالعــه شناســايي فيلوژنــي اشرشــيا كلــي بــر اســاس روش كلرمونــت و بررســي الگــوي مقاومــت آنهاســت. در ايــن مطالعــه از نواحــي مختلــف ســواحل بوشــهر نمونــه بــرداري صــورت گرفــت و 120 ســويه اشرشــيا كلــي جداســازي شــد. در مرحلــه بعــد گــروه هــاي فيلوژنــي آن بــر اســاس روش واكنــش زنجيــره اي پليمــراز چهارگانــه و همچنيــن روش مقاومــت دارويــي بــه روش انتشــار در ديســك مــورد بررســي قــرار گرفــت. در بيــن گروههــاي فيلوژنــي نتايــج بدســت آمــده شــامل فراوانــي هــاي: )%19/16( A ، گــروه)%20( Clade I/II (3/33%) ،E (13/3%) ،C (17/5%) ،B2 (2/5%) ، B1 و ســويه هايــي كــه در هيــچ طبقــه بنــدي فيلوژنــي قــرار نمــي گيرنــد؛ تحــت عنــوان گروههــاي ناشــناخته2 هســتند كــه )%21/6( فراوانــي را بــه خــود اختصــاص دادنــد. بــر اســاس آزمايشــات انجــام شــده؛ بيشــترين الگــوي مقاومــت دارويــي مربــوط بــه آنتــي بيوتيــك آمپــي ســيلين و تتراســايكلين مــي باشــد كــه در بيــن گــروه هــاي B1 بــا فراوانــي )%31/48( مشــاهده شــد. بــا توجــه بــه مطالعــات صــورت گرفتــه در ايــن پژوهــش، مشــاهده شــد اكثريــت گروههــاي اشرشــيا كلــي بــه گــروه فيلوژنــي گروههــاي ناشــناخته تعلــق داشــته و گــروه B2 در بيــن گروههــا كمتريــن شــيوع را دارنــد. بــر اســاس تحقيقــات انجــام شــده بــه روش طبقــه بنــدي جديــد كلرمونــت مشــاهده شــد 34% از ســويه هــاي جداشــده متعلــق بــه گروههــاي جديــد فيلوژنــي: C, E, F و Clade I/II هســتند.