آناليز بيوانفورماتيكي ترنسپورترهاي HKT گياهان

يكي از مهمترين تنشهايي كه رشد و عملكرد گياهان زراعي را كاهش مي دهد، تنش شوري است. به همين خاطر به منظور كاهش اثرات مضر اين تنش، محققين در زمينه هاي تحقيقاتي مختلفي مشغول مطالعه و تحقيق هستند. يكي از اين زمينه ها كار بر روي ترنسپورترهاي HKT است. HKTها نقشي حياتي در تحمل هر دو گروه گياهان تك لپه و دو لپه به تنش شوري دارند. هدف از اين مطالعه آناليز بيوانفورماتيكي تواليهاي ترانسپورترهاي HKT موجود در پايگاهاي اطلاعاتي به منظور مشخص كردن شباهتها و تفاوتهاي عمده آنها است. توالي هاي ژنومي از پايگاه داده¬اي NCBI بدست آمد. آناليز بيوانفوماتيك بوسيله نرم افزارهاي Mega و Gene runner و نيز BlastP و ExPaSy بصورت آنلاين انجام شد. نتايج همترازي نشان داد اسيد آمينه هاي Gly، Ser، Leu در تمامي توالي ها بيشترين اسيدآمينه هاي حفاظت شده هستند. نتايج تجزيه كلاستر تواليهاي cDNA و اسيدهاي آمينه نشان داد كه با استفاده از هر دو نوع توالي تمامي ترانسپورترها در سه گروه عمده قرار گرفتند كه در گروه اول HKT هاي انتقال دهنده پتاسيم، در گروه دوم انتقال دهنده هاي سديم و در گروه سوم ترنسپورترهاي يافت شده از خزه ها قرار گرفتند.