بررسي خصوصيات فنوتيپي و تنوع ژنتيكي جدايه هاي مخمري عامل شانكر درختان هسته دار در استان اصفهان

Study of phenotypic characteristics and genetic diversity of yeast isolates of the canker of nuclear trees in Isfahan province

توليد ميوه¬هاي هسته¬دار در ايران در سال¬هاي اخير رو به افزايش بوده است. در برخي از سال¬ها عواملي همچون آفات و بيماري¬ها بر ميزان توليد آن¬ها در برخي مناطق اثر مي¬گذارند كه بيان كننده¬ي لزوم بررسي اين عوامل و شناسايي و كنترل آن¬ها مي باشد. شناسايي دقيق عامل بيماري و بررسي تنوع فنوتيپي و ژنوتيپي آن¬ها براي اعمال روش¬هاي كنترل ضروري است. بدين منظور در سال 1395 از باغ¬هاي شهر¬هاي مختلف استان اصفهان نمونه¬برداري و جداسازي عوامل همراه بيماري روي محيط¬هاي كشت ميكروبي انجام شد. يازده جدايه به دست آمده مورد بررسي قرار گرفتند. شناسايي جدايه¬ها با آزمون¬هاي بيوشيميايي و فيزيولوژيك انجام گرفت. به منظور ارزيابي دامنه تنوع ژنتيكي جدايه¬ها،DNA ژنومي در واكنش زنجيرهاي پليمراز با روش BOX-PCR به كار برده شد. از ضريب تشابه جاكارد براي تعيين تشابه جدايه¬ها و ازروش UPGMA و نرم افزار NTYSYS-pc براي آناليز خوشه¬اي استفاده شد . طبق نتايج جدايه¬ها به عنوان Cryptococcus spp. شناسايي شدند، جدايه¬ها براساس خصوصيات فنوتيپي اختلافاتي جزئي را نشان دادند. آناليز خوشه¬اي نتايج، نشان داد كه در سطح تشابه 50 درصد جدايه¬ها به 4 گروه قابل تقسيم¬اند. نتايج فوق مي¬تواند نشانگر تنوع درون گروهي باشد.

The production of native fruits in Iran has increased in recent years. In some years, factors such as pests and diseases affect their production in some areas, which indicates the need to examine these factors and identify and control them.The exact identification of the disease agent and the evaluation of their phenotypic and genotypic variation is essential for applying control methods. For this purpose, in 1395, gardens of different cities of Isfahan province were sampled and isolation of pathogenic agents on microbial culture media was performed. Eleven isolated isolates were studied. Identification of isolates was carried out using biochemical and physiological tests. In order to evaluate the genetic diversity of the isolates, genomic DNA was extracted from them and used for polymerase chain reaction using BOX-PCR method. The propagated product was stained with agarose gel 1.2% electrophoresis and stained with ethidium bromide. Jaccard s similarity coefficient was used to determine the similarity of isolates using UPGMA and NTYSYS-pc software for cluster analysis. According to the results of isolates as Cryptococcus spp. The isolates showed slight differences based on phenotypic characteristics. The cluster analysis of the results showed that at the level of similarity, 50% of isolates could be divided into 4 groups. The above results can indicate intra-group variation.