توالي يابي نمونه قارچي با كد شناسايي 18 از طريق نواحيITS1 وITS4

Sequence of the fungal sample with 18 identification code through ITS1 and ITS4 regions

با پيشرفت هاي اخير در زيست شناسي مولكولي و توسعه فناوري هايي مثل توالي يابي ژني و ژنومي، كشف و شناسايي گونه هاي جديد در گروه هاي مختلف موجودات زنده به ويژه قارچ ها روند افزايشي به خود گرفته است. همچنين با توجه به ناكارآمدي روش هاي مبتني بر مورفولوژي براي شناسايي گونه هاي قارچي، استفاده از تكنيك هاي جديد مبتني بر داده هاي DNA، جايگاه خاصي را در شناسايي سريع و دقيق گونه هاي قارچي پيدا كرده است. توالي يابي از طريق نواحي فاصله انداز بين ژني اپران RNA ريبوزومي يكي از اين تكنيك ها مي باشد. بدين منظور ژن نمونه با كد شناسايي 18 پس از جداسازي و استخراج DNA وتكثير با PCR توسط شركت Bioneer توالي يابي شد، سپس توالي شناسايي شده پس از ويرايش، در موتور جستجوي بانك جهاني (NCBI) مورد همرديفي (BLAST) قرار گرفت. نتايج بدست آمده از طريق همرديفي و آناليز خوشه-اي روابط فيلوژني نشان داد كه نمونه قارچي با كد شناسايي 18 داراي همولوژي بالاي 99 درصد با گونه هاي دو جنس Microsphaeropsis و Phoma مي باشد.