شناسايي نواحي ژنومي كنترل كننده انباشت كادميم دربافت‌هاي برنج باروش مكانيابي ارتباطي

تنش فلزات سنگين يكي از تنش‌هاي غير زيستي مهم است كه رشد و عملكرد گياهان را در مناطق آلوده تحت تاثير قرار مي‌دهد. عليرغم قابليت بالاي روش مكانيابي ارتباطي براي شناسايي جايگا هاي كنترل كننده صفات كمّي (QTL)، از اين روش قدرتمند براي شناسايي دقيق نواحي ژنومي كنترل كننده تحمل به كادميمدر برنج و در نتيجه براي شناسايي و جداسازي ژن‌هاي تحمل به اين تنش تاكنون استفاده نشده است. بنابراين در اين تحقيق تلاش شدهبا روش مكانيابي ارتباطي با استفاده از۳۷ هزار نشانگر SNPتحت مدل خطي مختلط (MLM)، نواحي ژنومي دقيق مرتبط با انباشت كادميم در ريشه و ساقه برنج شناسايي گردند.بر اساس نتايج مكانيابي ارتباطي در شرايط تنش كادميم ۱۲ ناحيه ژنومي براي انباشت كادميم در ساقه و ۱۳ ناحيه ژنومي براي انباشت كادميم در ريشه بر روي كروموزوم‌هاي مختلف برنج شناسايي شدند. اين QTLها از ۱۲ تا ۱/۱۹ درصد تنوع فنوتيپي را توجيه مي‌كنند كه به نظر مي‌رسد در اين نواحي ژن‌هاي بزرگ اثر به همراه ژن‌هاي كوچك اثري قرار داشته باشند.همچنين، يكناحيه ژنومي مشترك واقع بر روي بازوي بلند كروموزوم ۴ براي كنترل هر دو خصوصيت تحت تنش كادميم، شناسايي شد. نتايج اين تحقيق مي‌تواند به جداسازي ژن‌هاي جديد كنترل كننده تحمل به تنش كادميم منجر شود.