شماره ركورد كنفرانس :
4678
عنوان مقاله :
آناليزبيوانفورماتيكي ژن SWN2در گياه برنج (Oryza sativa)
پديدآورندگان :
كرمي معلم سمانه دانشجوي دكتري بيوتكنولوژي كشاورزي دانشگاه شهيدبهشتي , احمدي خواه اسدالله هيئت علمي گروه علوم و زيست فناوري گياهي دانشگاه شهيدبهشتي
كليدواژه :
برنج , ديواره سلولي ثانويه , عوامل رونويسي , SWN2 , قابليت هضم پذيري
عنوان كنفرانس :
سومين كنگره بين المللي و پانزدهمين كنگره ملي علوم زراعت و اصلاح نباتات ايران
چكيده فارسي :
بافت‌هاي گياهي كه نيازمند ضخامت ساختماني هستند ديواره سلولي ثانويه محكم و ضخيمي از جنس ليگنين، سلولز و همي‌سلولز بصورت پل‌هاي ساختماني پيچيده تشكيل مي‌دهند. تنظيم كننده‌هاي اصلي سنتز ديواره سلولي ثانويه در دولپه‌اي‌ها و همچنين ارتولوگ‌هاي آنها در تك لپه‌اي‌ها شناسايي شده و تنظيم تشكيل ديواره سلولي ثانويه در تك لپه‌اي‌ها بطور گسترده مورد مطالعه قرار گرفته است. فاكتور رونويسي به نام SECONDARY WALL NAC DOMAIN PROTEINs (SWNs)، قابليت تنظيم تشكيل ديواره سلولي ثانويه گياه برنج (Oryza sativa)را دارا مي‌باشد و پتانسيل بالايي در مهندسي ديواره گياهان تك‌لپه دارد. آناليزهاي بيوانفورماتيكي ژن و پروتئين مربوط به اين فاكتور رونويسي در واريته جاپونيكا برنج بررسي شد. نتايج حاكي از نقش موثر اين پروتئين در مسير سنتز ديواره سلولي ثانويه بوده است كه مشخص شد خاموشي و يا پايين بودن سطح بيان اين پروتئين منجر به كاهش ضخامت ديواره سلولي ثانويه گياهان شده و در نتيجه باعث بهبود قابليت هضم پذيري علوفه و به تبع آن بالا رفتن كيفيت شير و گوشت دامي خواهد شد.با توجه به آناليزهاي انجام شده، ژنSWN2برنجداراي همولوژي نسبتاً بالايي با ساير نسخه‌هاي SWN2دربانك ژن مي‌باشد، البته تفاوتهاي محسوسي هم در بخشي از توالي نوكلئوتيدي آن با ساير همولوگ‌هاي خود در واريته‌هايمختلف برنج نشان مي‌دهد كه از اين تفاوت‌ها مي‌توان براي طراحي پرايمرهاي مناسب جهت آشكارسازي پليمورفيسم بينواريتههاي مختلف برنج در يك واكنش ساده PCRسود جست؛ همچنين هر چند پروتئين اين ژن با پروتئين ژن‌هاي درگيردر نمو ديواره سلولي ثانويه در ساير گونههاي گياهي همولوژي متوسطي نشان داد، اما يك ناحيه حفاظت شده بين آنها شناسايي شدكه به نظر مي‌رسد دامين حفاظت شده NACدر پايانه Nاست كه نقش يك پروتئين متصل شونده به DNAرا بازي مي‌كند؛ اين پروتئين به مثابه يك فاكتور رونويسي براي ژن يا ژن‌هاي پائين دست دخيل در واكنش به فتوپريود و هورمون عمل مي‌كندكه باعث تنظيم يا تعيين مسير نموي ديواره سلولي ثانويهو مريستم انتهايي در برنج مي‌گردد.
