واكاوي ترانسكريپتوم گياه جو (Hordeum vulgare) بر اساس تكنيك RNA-Seq به منظور مطالعه ي كاركرد ژنوم و شناسايي ژن هاي كليدي در پاسخ به تنش شوري

تكنيك RNA sequencing (RNA-Seq) روشي نوين است كه امكان مطالعه ي دقيق ترانسكريپتوم به منظور روشن شدن نحوه فعاليت بخش هاي كد كننده و غير كد كننده ژنوم را در پاسخ به شرايط داخلي و بيروني گياه از جمله تنش هاي غيرزيستي فرآهم نموده است. درك چگونگي پاسخ به تنش در گياهان كه از چنين مطالعاتي حاصل مي شود، براي ايجاد گياهان متحمل به تنش و داراي پايداري عملكرد جهت حفظ امنيت غذايي بشر ضروري مي باشد. در اين پژوهش، به منظور مطالعه پاسخ گياه جو، به عنوان چهارمين گياه زراعي مهم در جهان، به تنش شوري در سطح ژنوم و شناسايي و معرفي ژن هاي مهم در پاسخ به تنش، با استفاده از ابزارها و روش هاي بيوانفورماتيك و آماري، داده هاي يك آزمايش RNA-Seq در شرايط تنش شوري واكاي گرديد. نتايج به روشني نشان داد كه فعاليت ژنوم گياه در شرايط تنش شوري به سمت پاسخ به تنش ها جهت گيري معني داري دارد. از 5692 ژن شناسايي شده كه داراي بيان افتراقي بودند، 2665 و 3027 ژن به ترتيب افزايش و كاهش بيان داشتند. بررسي شبكه ژني بين اين ژن ها مشخص نمود كه 6 ژن LOS2، F12E4 (Dbp)، HB-12، AAO3، MEKK1 و MDH، كه هر كدام در فرآيندهاي گسترده اي نقش دارند، نسبت به ديگر ژن ها داراي اهميت بيشتري هستند و مي توانند در دست ورزي تحمل به تنش به كار گرفته شوند.