بررسي ميزان اثر كروموزوم ها بر صحت درخت فيلوژنتيك

درختان فيلوژنتيك به طور گسترده اي براي مطالعات ژنتيكي و تكاملي در موجودات مختلف استفاده مي شوند. درختان فيلوژنتيكي در بسياري از مطالعات تكاملي براي نشان دادن شواهد در مورد روابط تكاملي بين موجودات موجود در داخل و يا درون موجودات، و براي مطالعه تكامل و نوآوري كاربردي ژن استفاده مي شوند .تكنولوژي توالي يابي پيشرفته به طور قابل ملاحظه اي داده هاي موجود براي ساخت درخت هاي فيلوژنتيكي مبتني بر پلي مورفيسم تك نوكلئوتيد (SNP) را غني كرده است. اين مطاالعه به منظور بررسي اثر كروموزوم ها بر صحت درخت فيلوژني بر اساس داده هاي SNP ي بود. بدين منظور از7250 SNP 500 راس گاو مربوط به سايت synbreed استفاده گرديد. داده ها به كمك نرم افزار r و پكيج synbreedData استخراج گرديد و مورد تجزيه تحليل قرار گرفتند. روابط فيلوژنتيك بر اساس ماتريس فاصله انجام گرفت. ماتريس فاصله به كمك نرم افزار پلينك محاسبه شد. نتايج حاصل از مقايسه همبستگي بين ماتريس فاصله كل اسنيپ ها با فاصله تك تك كروموزوم ها نشان داد كه همه ي كروموزوم ها با كل ژنوم همبستگي برابري دارند.