بررسي جايگاه تاكسونومي جدايه هاي باكتري سودوموناس در گروه پوتيدا و خصوصيات عملكردي آنها

گروه پوتيدا يكي از گروه هاي مهم در جنس سودوموناس مي باشد اين گروه داراي 17 تايپ استرين مي باشد. اعضاي اين گروه داراي توانمندي هاي مختلفي از جمله زيست پالايندگي، آنتاگونيستي، محرك رشد گياهي و برخي جدايه هاي كلينيكي مي باشند. در اين تحقيق جايگاه تاكسنومي 17 تايپ استرين و 46 جدايه مربوط به اين گروه بوسيله اتصال 3 ژن حفاظت شده rrS, rpoD و gyrB با رسم درخت فيلوژني بررسي گرديد. درخت فيلوژني رسم شده به 11 خوشه تقسيم شد. به منظور بررسي ارتباط بين درخت فيلوژني و خصوصيات عملكردي جدايه ها هر خوشه، توانايي هر جدايه از منابع مربوطه تعيين گرديد. بررسي جايگاه تاكسنومي جدايه ها اين گروه نشان داد كه تعداد زيادي از جدايه هاي اين گروه به اشتباه نامگذاري گرديدند كه نياز به بازنگري در نامگذاري مي باشند. همچنين مشخص گرديد برخي از خوشه ها محل تجمع جدايه هايي با توانمندي مشابه هستند. همه جدايه ها در خوشه يك جدايه هاي زيست پالاينده بوده و جدايه هاي موجود در خوشه هاي 3، 6 و 10 جدايه هاي مفيد گياهي مي باشند. برخي از خوشه ها نيز داراي چندين جدايه با توانايي هاي متفاوت و يا داراي جدايه هايي با چندين توانايي مي باشند. نتايج اين تحقيق نشان داد كه با بررسي فيلوژني جدايه هاي اين گروه مي توان تا حدودي خصوصيات عملكردي آنها را پيش بيني كرد.