شناسايي نشانگرهاي ريزماهواره¬اي جهت استفاده تنوع زيستي در شتر هاي دو كوهانه

Identification of microsatellites for biodiversity analysis in the Bactrian camel

شترها نقشي كليدي در تامين غذا براي مردمي دارند كه در بيابان‌هاي سرد و گرم جهان زندگي مي‌كنند. برخلاف شترهاي تك‌كوهانه، اندازه جمعيت شترهاي دوكوهانه كوچكتر بوده و در برخي كشورها مانند ايران، در خطر انقراض قرار دارند. در مطالعه حاضر ژنوم شتر هاي دو كوهانه توالي يابي و گردآوري گرديد و پراكنش ريزماهواره ها مورد بررسي قرار گرفت. جهت انجام آزمايش توالي يابي كامل ژنوم با استفاده از پلتفرم ايلومينا انچام گرديد سپس بعد از تعيين كيفيت و ارزيابي وضعيت تواليها، از برنامه MISA براي شناسايي ريز ماهواره هاي گسترده ژنوم استفاده شد. نتايج ارزيابي ها و آناليزهاي منجر به شناسايي 45753 ريزماهواره براي شترهاي دوكوهانه گرديد كه تقريباً Mb 3 ژنوم شتر هاي دو كوهانه را تشكيل مي دهد. كه نتايج بدست آمده تقريبا مشابه ساير پستانداران مي باشند. به توجه به شناسايي موثر نشانگرهاي ريزماهوره اي مي توان با طراحي استرانژي آميزشي مناسب باعث كاهش هم خوني و متعاقبا افزايش تنوع زيستي شده و از انقراض احتمالي در آينده بخصوص در مورد گونه هاي در حال انقراض مانند شتر بهره جست.

Camels play a key role in providing of food for people in hot and cold deserts. Unlike the dromedary camels, the population size of Bactrian camels is small and in some countries, such as Iran, they are at risk of extinction. In this study, whole genomes of Bactrian camel were sequence using Illumina Hiseq 2000 and assembled. To identify microsatellite markers, we use MISA program with some restriction. The results caused to identify 45753 microsatellite markers in Bactrain camels, which include 3 MB of camel genome similar to others mammalian. Regards to identification of affective microsatellite in this study, we could organized a suitable strategy to management of inbreeding level in the residual population that could help us to improve biodiversity in Bactrian camel.