شماره ركورد كنفرانس :
4709
عنوان مقاله :
مقايسه تكرار هاي شناسايي شده در شترهاي دو كوهانه با ديگر گونه ها
عنوان به زبان ديگر :
Comparison of identified repeated markers in Bactrian camels and other species
پديدآورندگان :
زارع ايوريق ناهيده بوستان nahid.zare1371@gmail.com گروه علوم دامي دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي، دانشگاه محقق اردبيلي , هدايت نعمت گروه علوم دگروه علوم دامي دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي، دانشگاه محقق اردبيليامي دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي، دانشگاه محقق اردبيلي , سيد شريفي رضا گروه علوم دامي دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي، دانشگاه محقق اردبيلي , خلخالي رضا گروه علوم دامي دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي، دانشگاه محقق اردبيلي , بوستان آزاده گروه علوم دامي دانشكده كشاورزي و منابع طبيعي، دانشگاه محقق اردبيلي
كليدواژه :
شتر هاي دوكوهانه , عناصر متحرك , سرهم سازي , تنوع زيستي
عنوان كنفرانس :
اولين كنفرانس بين المللي و چهارمين كنفرانس ملي صيانت از منابع طبيعي و محيط زيست
چكيده فارسي :
عناصر متحرك (TE ها) توالي هاي تكراري DNA هستند كه در ژنوم پيدا مي شوند در سراسر درخت زندگي پراكنده اند و اغلب به خاطر توانايي آنها در تكرار و حركت به مكان هاي جديد ژنومي به عنوان ژن هاي پرشي ناميده مي شوند. همچنين آنها منبع مهمي از تنوع ژنومي در هر دو سطح گونه و فردي فراهم مي كند. اين مطالعه با هدف شناسايي عناصر متحرك در ژنوم شترهاي دوكوهانه جهت استفاده در تنوع زيستي بالقوه انجام گرفت. جهت انجام آن توالي كامل ژنوم شتر دوكوهانه با استفاده از روش توالي يابي نسل جديد تهيه و سرهم سازي شد سپس از طريق برنامه Repeat Masker v4.0.7 با تركيب دو پايگاه اطلاعاتي Repbase و Dfam براي جستجوي عناصر متحرك شناسايي شده در ژنوم ها مورد استفاده قرار گرفت. بر اساس نتايج به دست آمده محتواي توالي هاي تكراري به دست آماده شتر هاي دوكوهانه 30.02 درصد كه اندكي كمتر از شتر تك كوهانه آفريقايي با 72/33% و شتر دو كوهانه با 68/33% بود كه خانواده LINE با 17.79 درصد توالي هاي تكراري بزرگترين گروه توالي هاي تكراري در شترهاي دوكوهانه هستند. همچنين اين مقدار كمتر از شتر تك كوهانه آفريقايي (8/19%) و شتر دوكوهانه (32/19%) بود. در اين خانواده LINE1 با 20/13% و RTE با 17/0 % به ترتيب بيشترين و كمترين سهم را به خود اختصاص داده اند.
چكيده لاتين :
Transposable elements (TEs) are repeated sequences in DNA that scattered during the genomes and they have ability to transfer in throughout of genome that called “cutter genes”. Also, it provides important resource for biodiversity in species. This study was performed to identify transposable elements in Bactrian camels, for this purpose we used next generation sequencing (NGS) and denovo assembly carry out using CLC genomic workbench. To identify TEs Repeat Masker v4.0.7 program was used. The results showed that 30.02 percent of Bactrian genome content of TEs that was less than African dromedary camel (33.72%). The LINE family with the 17.79 frequency was the most group in repeated sequences. LINE1 and RTE with 13.2 and 0.17 percent were the highest and lowest in the LINE family respectively.
