تجزيه فيلوژني و تكامل ملكولي سيتوكروم b

بررسي حاضر به منظور آگاهي از روند تكامل ژن سيتوكروم b در گونه‌هاي مختلف آناليز فيلوژني و روند انتخاب طبيعي در طي تكامل انجام گرفت. توالي ژن سيتوكروم b در گونه‌هاي مختلف بر اساس جستجو در بانك‌هاي اطلاعاتي ژنوم NCBI به دست آمده و همتراز شدند. درصد جانشيني و جايگزيني نوكلئوتيدها با استفاده از روش حداكثر درستنمايي و نيز ترسيم درخت فيلوژنتيك و تعيين روند انتخاب طبيعي به روشneighbor-joining به دست آمدند. نتايج حاصل از مطالعات بيوانفورماتيك نشان داد كه درصد جانشيني بازهاي پيريميديني بيشتر از بازهاي پوريني بوده است. مقدار عددي dN\dS كمتر از يك بود كه نشان دهنده انتخاب خالص در طي تكامل اين ژن ها است. اين نوع انتخاب سبب وقوع تغييرات در جايگاه‌هايي مي‌شود كه هيچ تغييري در توالي پروتئيني ژن‌ها حاصل نمي‌كند. اما از طرفي سبب مساعد شدن شرايط براي انتخاب مثبت در مراحل بعدي تكامل مي‌شود. درخت فيلوژنتيك براي ژن مذكور در موجودات مختلف نشان مي‌دهد كه به طور كلي پروتئين سيتوكرومb در موجودات مختلف بر اساس مسير تكاملي خود به دو دسته مجزا تقسيم مي‌شود.